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PATIKAweb:一个通过高级查询和可视化来分析生物途径的Web界面。

PATIKAweb: a Web interface for analyzing biological pathways through advanced querying and visualization.

作者信息

Dogrusoz U, Erson E Z, Giral E, Demir E, Babur O, Cetintas A, Colak R

机构信息

Bilkent Center for Bioinformatics (BCBI), Bilkent University, Ankara 06800, Turkey.

出版信息

Bioinformatics. 2006 Feb 1;22(3):374-5. doi: 10.1093/bioinformatics/bti776. Epub 2005 Nov 15.

DOI:10.1093/bioinformatics/bti776
PMID:16287939
Abstract

Patikaweb provides a Web interface for retrieving and analyzing biological pathways in the Patika database, which contains data integrated from various prominent public pathway databases. It features a user-friendly interface, dynamic visualization and automated layout, advanced graph-theoretic queries for extracting biologically important phenomena, local persistence capability and exporting facilities to various pathway exchange formats.

摘要

Patikaweb提供了一个Web界面,用于检索和分析Patika数据库中的生物途径,该数据库包含从各种著名的公共途径数据库整合的数据。它具有用户友好的界面、动态可视化和自动布局、用于提取生物学重要现象的高级图论查询、本地持久化功能以及导出到各种途径交换格式的工具。

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