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微小RNA组学——微小RNA基因的生物信息学

miRNomics-The bioinformatics of microRNA genes.

作者信息

Ghosh Zhumur, Chakrabarti Jayprokas, Mallick Bibekanand

机构信息

Computational Biology Group, Indian Association for the Cultivation of Science, 2A & 2B, Raja S.C. Mullick Road, Jadavpur, Calcutta 700032, India.

出版信息

Biochem Biophys Res Commun. 2007 Nov 9;363(1):6-11. doi: 10.1016/j.bbrc.2007.08.030. Epub 2007 Aug 13.

Abstract

MicroRNAs (miRNAs) are tiny genetic rheostats in plants, animals, and viruses, regulating the expression of messenger RNAs by targeting transcripts for cleavage or translational repression. Their regulatory impact is even more pervasive as a potential therapeutic tool. Since inception, computational methods have been an invaluable tool complementing experimental approaches. Here, we outline miRNA-bioinformatics highlighting the biological and therapeutic repertoire of miRNAs, in silico prediction of miRNA genes and their targets, along with a glimpse of the bioinformatic challenges that lie ahead.

摘要

微小RNA(miRNA)是植物、动物和病毒中的微小基因变阻器,通过靶向转录本进行切割或翻译抑制来调节信使RNA的表达。作为一种潜在的治疗工具,它们的调节作用更为广泛。自诞生以来,计算方法一直是补充实验方法的宝贵工具。在这里,我们概述了miRNA生物信息学,重点介绍了miRNA的生物学和治疗功能、miRNA基因及其靶标的计算机预测,以及对未来生物信息学挑战的一瞥。

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