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对所选昆虫病原线虫(斯氏线虫科、异小杆线虫科)的PCR扩增ITS和26S核糖体RNA基因的限制性片段长度多态性分析

RFLP Analysis of PCR Amplified ITS and 26S Ribosomal RNA Genes of Selected Entomopathogenic Nematodes (Steinernematidae, Heterorhabditidae).

作者信息

Nasmith C G, Speranzini D, Jeng R, Hubbes M

出版信息

J Nematol. 1996 Mar;28(1):15-25.

Abstract

This study examined the polymerase chain reaction (PCR) amplified internal transcribed spacer (ITS) and 26S ribosomal DNA (rDNA) regions of 15 entomopathogenic nematode isolates including Steinernema feltiae syn. bibionis, S. glaseri, seven strains of S. carpocapsae, four strains of Heterorhabditis bacteriophora, and two field isolates. RDNA length variation was not observed among the isolates examined. Restriction fragment length polymorphisms (RFLP) of PCR amplified ITS and 26S regions provided specific banding patterns for all isolates but S. feltiae syn. bibionis and S. glaseri. These two species were separated by zymograms of esterase and tetrazolium oxidase. A field trapping method retrieved two isolates of naturally occurring nematodes. One field isolate collected (F1) displayed banding patterns identical to those of S. carpocapsae DD136 released in the same location 1 year earlier. The second field isolate (F2) had unique PCR-RFLP profiles compared with all other strains. This study provides a rapid molecular taxonomic method to more fully establish species relationships among members of Steinernema and Heterorhabditis.

摘要

本研究检测了15株昆虫病原线虫分离株的聚合酶链反应(PCR)扩增的内转录间隔区(ITS)和26S核糖体DNA(rDNA)区域,这些分离株包括食菌 Steinernema feltiae(同物异名 bibionis)、格拉斯eri Steinernema glaseri、7株小菜蛾 Steinernema carpocapsae、4株嗜菌异小杆线虫 Heterorhabditis bacteriophora 以及2株田间分离株。在所检测的分离株中未观察到rDNA长度变异。PCR扩增的ITS和26S区域的限制性片段长度多态性(RFLP)为除食菌 Steinernema feltiae(同物异名 bibionis)和格拉斯eri Steinernema glaseri 之外的所有分离株提供了特异性条带模式。这两个物种通过酯酶和四氮唑氧化酶的酶谱进行区分。一种田间诱捕方法获取了2株自然存在的线虫分离株。采集的一株田间分离株(F1)显示出与1年前在同一地点释放的小菜蛾 Steinernema carpocapsae DD136相同的条带模式。与所有其他菌株相比,第二株田间分离株(F2)具有独特的PCR-RFLP图谱。本研究提供了一种快速的分子分类方法,以更全面地确定 Steinernema 和 Heterorhabditis 成员之间的物种关系。

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