大规模全基因组关联研究在东亚人群中鉴定出影响代谢特征的新遗传位点。
Large-scale genome-wide association studies in East Asians identify new genetic loci influencing metabolic traits.
机构信息
Center for Genome Science, National Institute of Health, Osong Health Technology Administration Complex, Chungcheongbuk-do, Korea.
出版信息
Nat Genet. 2011 Sep 11;43(10):990-5. doi: 10.1038/ng.939.
To identify the genetic bases for nine metabolic traits, we conducted a meta-analysis combining Korean genome-wide association results from the KARE project (n = 8,842) and the HEXA shared control study (n = 3,703). We verified the associations of the loci selected from the discovery meta-analysis in the replication stage (30,395 individuals from the BioBank Japan genome-wide association study and individuals comprising the Health2 and Shanghai Jiao Tong University Diabetes cohorts). We identified ten genome-wide significant signals newly associated with traits from an overall meta-analysis. The most compelling associations involved 12q24.11 (near MYL2) and 12q24.13 (in C12orf51) for high-density lipoprotein cholesterol, 2p21 (near SIX2-SIX3) for fasting plasma glucose, 19q13.33 (in RPS11) and 6q22.33 (in RSPO3) for renal traits, and 12q24.11 (near MYL2), 12q24.13 (in C12orf51 and near OAS1), 4q31.22 (in ZNF827) and 7q11.23 (near TBL2-BCL7B) for hepatic traits. These findings highlight previously unknown biological pathways for metabolic traits investigated in this study.
为了确定九个代谢特征的遗传基础，我们进行了一项荟萃分析，结合了 KARE 项目（n=8842）和 HEXA 共享对照研究（n=3703）的韩国全基因组关联研究结果。我们在复制阶段（来自 BioBank Japan 全基因组关联研究的 30395 名个体和包含 Health2 和上海交通大学糖尿病队列的个体）验证了从发现荟萃分析中选择的位点的关联。我们通过总体荟萃分析确定了与特征新相关的十个全基因组显著信号。最引人注目的关联涉及高密度脂蛋白胆固醇的 12q24.11（靠近 MYL2）和 12q24.13（在 C12orf51 中），空腹血浆葡萄糖的 2p21（靠近 SIX2-SIX3），肾脏特征的 19q13.33（在 RPS11 中）和 6q22.33（在 RSPO3 中），以及高密度脂蛋白胆固醇的 12q24.11（靠近 MYL2），12q24.13（在 C12orf51 和靠近 OAS1），4q31.22（在 ZNF827 中）和 7q11.23（靠近 TBL2-BCL7B），肝脏特征。这些发现突出了本研究中研究的代谢特征的先前未知的生物学途径。
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