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从日本稻田土壤中分离出的一株砷酸盐呼吸细菌——地杆菌属菌株OR-1的基因组序列草图

Draft Genome Sequence of Geobacter sp. Strain OR-1, an Arsenate-Respiring Bacterium Isolated from Japanese Paddy Soil.

作者信息

Ehara Ayaka, Suzuki Haruo, Amachi Seigo

机构信息

Graduate School of Horticulture, Chiba University, Matsudo, Matsudo City, Chiba, Japan.

Graduate School of Science and Engineering, Yamaguchi University, Yoshida, Yamaguchi, Japan.

出版信息

Genome Announc. 2015 Jan 29;3(1):e01478-14. doi: 10.1128/genomeA.01478-14.

DOI:10.1128/genomeA.01478-14
PMID:25635012
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4319506/
Abstract

Here, we report a draft genome sequence of Geobacter sp. strain OR-1, an arsenate-respiring bacterium isolated from Japanese paddy soil. It contained two distinct arsenic islands, one including genes for a respiratory arsenate reductase (Arr) as well as for arsenic resistance (arsD-arsA-acr3-arsR-arrA-arrB) and the second containing only genes for arsenic resistance.

摘要

在此，我们报告了地杆菌属菌株OR-1的基因组序列草图，该菌株是从日本稻田土壤中分离出的一种以砷酸盐为呼吸底物的细菌。它包含两个不同的砷岛，一个包含呼吸型砷酸盐还原酶（Arr）以及砷抗性（arsD-arsA-acr3-arsR-arrA-arrB）相关基因，另一个仅包含砷抗性相关基因。