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DICER 辅因子 TARBP2 和 PRKRA 在小鼠胚胎发生过程中的功能冗余不涉及 miRNA 生物发生。

Functional Redundancy of DICER Cofactors TARBP2 and PRKRA During Murine Embryogenesis Does Not Involve miRNA Biogenesis.

机构信息

The Jackson Laboratory, Bar Harbor, Maine 04609.

Graduate School of Biomedical Sciences and Engineering, The University of Maine, Orono, Maine 04469.

出版信息

Genetics. 2018 Apr;208(4):1513-1522. doi: 10.1534/genetics.118.300791. Epub 2018 Feb 21.

Abstract

Several studies have suggested that canonical microRNA (miRNA) biogenesis requires the DICER cofactors TARBP2 and PRKRA for processing of pre-miRNAs to mature miRNAs. To investigate the roles of TARBP2 and PRKRA in miRNA biogenesis , and to determine possible functional redundancy, we first compared the phenotypes of and single and double mutants. In contrast to embryos, which die by embryonic day 7.5 (E7.5), single and mice survive beyond E7.5 and either die perinatally or survive and exhibit cranial/facial abnormalities, respectively. In contrast, only a few ; double mutants survived beyond E12.5, suggesting genetic redundancy between and during embryonic development. Sequencing of miRNAs from single-mutant embryos at E15.5 revealed changes in abundance and isomiR type in , but not , embryos, demonstrating that TARBP2, but not PRKRA, functions in miRNA biogenesis of a subclass of miRNAs, and suggesting that functional redundancy between TARBP2 and PRKRA does not involve miRNA biogenesis.

摘要

几项研究表明,经典 microRNA(miRNA)生物发生需要 DICER 辅助因子 TARBP2 和 PRKRA 来将 pre-miRNA 加工为成熟 miRNA。为了研究 TARBP2 和 PRKRA 在 miRNA 生物发生中的作用,并确定可能的功能冗余,我们首先比较了 和 单突变体和双突变体的表型。与胚胎在第 7.5 天(E7.5)死亡的 胚胎不同, 和 单突变体小鼠在 E7.5 后存活,并分别在围产期死亡或存活且表现出头颅/面部异常。相比之下,只有少数 ; 双突变体在 E12.5 后存活,这表明在胚胎发育过程中 和 之间存在遗传冗余。在 E15.5 时从单突变体胚胎中测序 miRNA 发现,在 胚胎中 miRNA 的丰度和同型发生了变化,但在 胚胎中没有变化,这表明 TARBP2 而不是 PRKRA 在一类 miRNA 的 miRNA 生物发生中起作用,并表明 TARBP2 和 PRKRA 之间的功能冗余不涉及 miRNA 生物发生。

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