Suppr超能文献

基于有根四重奏的系统发育树平衡指数。

A balance index for phylogenetic trees based on rooted quartets.

作者信息

Coronado Tomás M, Mir Arnau, Rosselló Francesc, Valiente Gabriel

机构信息

Department of Mathematics and Computer Science, University of the Balearic Islands, 07122, Palma, Spain.

Balearic Islands Health Research Institute (IdISBa), 07010, Palma, Spain.

出版信息

J Math Biol. 2019 Aug;79(3):1105-1148. doi: 10.1007/s00285-019-01377-w. Epub 2019 Jun 17.

Abstract

We define a new balance index for rooted phylogenetic trees based on the symmetry of the evolutive history of every set of 4 leaves. This index makes sense for multifurcating trees and it can be computed in time linear in the number of leaves. We determine its maximum and minimum values for arbitrary and bifurcating trees, and we provide exact formulas for its expected value and variance on bifurcating trees under Ford's [Formula: see text]-model and Aldous' [Formula: see text]-model and on arbitrary trees under the [Formula: see text]-[Formula: see text]-model.

摘要

我们基于每组4个叶节点的进化历史的对称性,为有根系统发育树定义了一个新的平衡指数。该指数对多歧树有意义,并且可以在叶节点数量的线性时间内计算出来。我们确定了任意树和二叉树的该指数的最大值和最小值,并给出了在福特[公式:见原文]模型和奥尔多斯[公式:见原文]模型下二叉树以及在[公式:见原文]-[公式:见原文]模型下任意树的该指数的期望值和方差的精确公式。

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