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水苏(Bacopa monnieri)转录组挖掘揭示了两种可能的新型弹状病毒和一种索伦病毒的基因组序列。

Mining of the water hyssop (Bacopa monnieri) transcriptome reveals genome sequences of two putative novel rhabdoviruses and a solendovirus.

机构信息

Division of Plant Pathology, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India.

Institute of Forest Biodiversity (ICFRE), Hyderabad, India.

出版信息

Arch Virol. 2021 Jul;166(7):1985-1990. doi: 10.1007/s00705-021-05061-7. Epub 2021 Apr 21.

Abstract

The genomes of three putative novel viruses, tentatively named "Bacopa monnieri virus 1" (BmV1), "Bacopa monnieri virus 2" (BmV2), and "Bacopa monnieri virus 3" (BmV3) were identified in the transcriptome dataset of a medicinally important herb - water hyssop (Bacopa monnieri (L.) Wettst.). The BmV1 and BmV2 genomes resemble those of plant rhabdoviruses. The 13.3-kb-long BmV1 genome contains eight antisense ORFs in the order 3' l-N-P2'-P-P3-M-G-P6-L-t 5', with P2' ORF overlapping with P, while the 13.2-kb BmV2 genome contains six interspersed ORFs in the antisense orientation (3' l-N-P-P3-M-G-L-t 5'). The 8-kb BmV3 genome possesses five overlapping ORFs, with ORFs 2 to 5 being similar to those of solendoviruses. Based on genome organization, sequence similarity, and phylogeny, BmV1, BmV2, and BmV3 can be regarded as new members of the genera Cytorhabdovirus, Betanucleorhabdovirus, and Solendovirus, respectively.

摘要

从一种药用植物水苏(Bacopa monnieri (L.) Wettst.)的转录组数据集中鉴定出了三种假定的新型病毒,暂定名为“Bacopa monnieri 病毒 1”(BmV1)、“Bacopa monnieri 病毒 2”(BmV2)和“Bacopa monnieri 病毒 3”(BmV3)。BmV1 和 BmV2 基因组与植物弹状病毒的基因组相似。长 13.3kb 的 BmV1 基因组包含 8 个反义 ORF,顺序为 3' l-N-P2'-P-P3-M-G-P6-L-t5',其中 P2'ORF 与 P 重叠,而长 13.2kb 的 BmV2 基因组包含 6 个交错的反义 ORF(3' l-N-P-P3-M-G-L-t5')。长 8kb 的 BmV3 基因组包含 5 个重叠的 ORF,ORF2 到 ORF5 与 Solendoviruses 相似。根据基因组组织、序列相似性和系统发育,BmV1、BmV2 和 BmV3 分别可被视为 Cytorhabdovirus、Betanucleorhabdovirus 和 Solendovirus 属的新成员。

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