从冷冻的人皮下脂肪组织中分离细胞核，用于全长单细胞转录谱分析。

Isolation of nuclei from frozen human subcutaneous adipose tissue for full-length single-nuclei transcriptional profiling.

机构信息

Translational Research Institute, AdventHealth, Orlando, FL 32804, USA.

出版信息

STAR Protoc. 2023 Mar 17;4(1):102054. doi: 10.1016/j.xpro.2023.102054. Epub 2023 Jan 20.

DOI:10.1016/j.xpro.2023.102054

PMID:36853719

原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9876942/

Abstract

Automated single-cell dispensing is incompatible with white adipose tissue (WAT) due to lipid-laden adipocytes. Single-nuclei RNA-Seq permits transcriptional profiling of all cells from WAT. Human WAT faces unique technical challenges in isolating nuclei compared to rodent tissue due to greater extra-cellular matrix content and larger lipid droplets. In this protocol, we detail how to isolate nuclei from frozen subcutaneous human WAT for single-nuclei RNA-Seq. For complete information on the generation and use of this protocol, please refer to Whytock et al. (2022)..

摘要

自动化单细胞分配技术不适用于富含脂质的脂肪细胞，因此无法用于白色脂肪组织（WAT）。单细胞 RNA 测序可对 WAT 中的所有细胞进行转录谱分析。与啮齿动物组织相比，人类 WAT 由于细胞外基质含量更高和更大的脂滴，因此在分离核方面面临独特的技术挑战。在本方案中，我们详细介绍了如何从冷冻的皮下人类 WAT 中分离细胞核用于单细胞 RNA 测序。有关此方案的生成和使用的完整信息，请参阅 Whytock 等人（2022 年）。