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2024 年 EMBL-EBI 作业调度程序序列分析工具框架

The EMBL-EBI Job Dispatcher sequence analysis tools framework in 2024.

机构信息

European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SD, UK.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2024 Jul 5;52(W1):W521-W525. doi: 10.1093/nar/gkae241.

Abstract

The EMBL-EBI Job Dispatcher sequence analysis tools framework (https://www.ebi.ac.uk/jdispatcher) enables the scientific community to perform a diverse range of sequence analyses using popular bioinformatics applications. Free access to the tools and required sequence datasets is provided through user-friendly web applications, as well as via RESTful and SOAP-based APIs. These are integrated into popular EMBL-EBI resources such as UniProt, InterPro, ENA and Ensembl Genomes. This paper overviews recent improvements to Job Dispatcher, including its brand new website and documentation, enhanced visualisations, improved job management, and a rising trend of user reliance on the service from low- and middle-income regions.

摘要

EMBL-EBI 作业调度程序序列分析工具框架(https://www.ebi.ac.uk/jdispatcher)使科学界能够使用流行的生物信息学应用程序进行各种序列分析。通过用户友好的 Web 应用程序以及基于 RESTful 和 SOAP 的 API,免费提供工具和所需的序列数据集。这些工具已集成到流行的 EMBL-EBI 资源中,如 UniProt、InterPro、ENA 和 Ensembl Genomes。本文概述了 Job Dispatcher 的最新改进,包括全新的网站和文档、增强的可视化效果、改进的作业管理,以及来自低收入和中等收入地区的用户对该服务的依赖程度不断上升的趋势。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b067/11223882/812ef92d2595/gkae241figgra1.jpg

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