• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

用于检验数量性状的关联和连锁的回归方法的功效比较。

Power comparison of regression methods to test quantitative traits for association and linkage.

作者信息

Zhu X, Elston R C

机构信息

Department of Epidemiology and Biostatistics, Case Western Reserve University, MetroHealth Medical Center, Cleveland, Ohio 44109-1998, USA.

出版信息

Genet Epidemiol. 2000 Apr;18(4):322-30. doi: 10.1002/(SICI)1098-2272(200004)18:4<322::AID-GEPI5>3.0.CO;2-#.

DOI:10.1002/(SICI)1098-2272(200004)18:4<322::AID-GEPI5>3.0.CO;2-#
PMID:10797592
Abstract

George et al. [1999 Am J Hum Genet 65:236-245] proposed a regression-based TDT method for quantitative traits consisting of regressing the trait on the parental transmission of a marker allele. Zhu and Elston [2000] also developed a TDT method for quantitative traits by defining a linear transformation to condition out founder information. Both methods test the null hypothesis of no linkage or association and can be applied to general pedigree structures. In this paper, we compare the power of these two methods through simulation, sampling those nuclear families with at least one heterozygous parent. Overall, we find that a variant of Zhu and Elston's method with 2 d.f. is more powerful. However, if the mode of inheritance is known, then a most powerful test with 1 d.f. can be found. All these regression TDT tests require linkage to detect association, but a test that does not require linkage will be more powerful.

摘要

乔治等人[1999年《美国人类遗传学杂志》65:236 - 245]提出了一种基于回归的定量性状传递不平衡检验(TDT)方法,该方法是将性状对标记等位基因的亲本传递进行回归分析。朱和埃尔斯顿[2000年]也开发了一种针对定量性状的TDT方法,通过定义一种线性变换来排除奠基者信息。这两种方法都检验无连锁或关联的零假设,并且可应用于一般的家系结构。在本文中,我们通过模拟比较这两种方法的检验效能,对至少有一个杂合亲本的核心家庭进行抽样。总体而言,我们发现朱和埃尔斯顿方法的一个自由度为2的变体检验效能更高。然而,如果遗传模式已知,那么可以找到一个自由度为1的最具检验效能的检验方法。所有这些基于回归的TDT检验都需要连锁来检测关联,但一种不需要连锁的检验方法将更具检验效能。

相似文献

1
Power comparison of regression methods to test quantitative traits for association and linkage.用于检验数量性状的关联和连锁的回归方法的功效比较。
Genet Epidemiol. 2000 Apr;18(4):322-30. doi: 10.1002/(SICI)1098-2272(200004)18:4<322::AID-GEPI5>3.0.CO;2-#.
2
Transmission/disequilibrium tests for quantitative traits.数量性状的传递/不平衡检验。
Genet Epidemiol. 2001 Jan;20(1):57-74. doi: 10.1002/1098-2272(200101)20:1<57::AID-GEPI6>3.0.CO;2-5.
3
A general class of association tests for family-based data using weight functions.一类使用权重函数对基于家系的数据进行的关联检验。
Genet Epidemiol. 2003 Apr;24(3):208-19. doi: 10.1002/gepi.10232.
4
Linkage and association studies of QTL for nuclear families by mixed models.利用混合模型对核心家庭数量性状基因座进行连锁和关联研究。
Biostatistics. 2003 Jan;4(1):75-95. doi: 10.1093/biostatistics/4.1.75.
5
Method for using complete and incomplete trios to identify genes related to a quantitative trait.使用完整和不完整三联体鉴定与数量性状相关基因的方法。
Genet Epidemiol. 2004 Jul;27(1):33-42. doi: 10.1002/gepi.20001.
6
Informative-transmission disequilibrium test (i-TDT): combined linkage and association mapping that includes unaffected offspring as well as affected offspring.信息传递不平衡检验(i-TDT):一种将连锁分析和关联分析相结合的方法,纳入了未患病后代以及患病后代。
Genet Epidemiol. 2007 Feb;31(2):115-33. doi: 10.1002/gepi.20195.
7
Removing phenotypic distribution assumptions from tests of linkage disequilibrium for quantitative traits.在数量性状连锁不平衡检验中去除表型分布假设。
Genet Epidemiol. 2003 Apr;24(3):191-9. doi: 10.1002/gepi.10220.
8
A Bayesian approach to the transmission/disequilibrium test for binary traits.一种用于二元性状传递/不平衡检验的贝叶斯方法。
Genet Epidemiol. 2002 Jan;22(1):41-51. doi: 10.1002/gepi.1042.
9
A robust linkage analysis method using combined allele sharing and transmission disequilibrium information from case-parent tetrad families.一种利用病例-亲代三联体家庭中联合等位基因共享和传递不平衡信息的稳健连锁分析方法。
Ann Hum Genet. 2008 Jul;72(Pt 4):575-87. doi: 10.1111/j.1469-1809.2008.00426.x. Epub 2008 Mar 14.
10
TDT statistics for mapping quantitative trait loci.用于定位数量性状基因座的TDT统计量。
Ann Hum Genet. 1998 Sep;62(Pt 5):431-52. doi: 10.1046/j.1469-1809.1998.6250431.x.

引用本文的文献

1
Combined linkage and association mapping of quantitative trait loci by multiple markers.利用多个标记对数量性状基因座进行连锁与关联的联合定位
Genetics. 2005 Jun;170(2):881-98. doi: 10.1534/genetics.104.035147. Epub 2005 Mar 31.
2
Nonparametric disequilibrium mapping of functional sites using haplotypes of multiple tightly linked single-nucleotide polymorphism markers.使用多个紧密连锁的单核苷酸多态性标记的单倍型对功能位点进行非参数不平衡定位。
Genetics. 2003 Jul;164(3):1175-87. doi: 10.1093/genetics/164.3.1175.