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锥虫科密码子使用情况和GC分布。

Trypanosomatidae codon usage and GC distribution.

作者信息

Alonso G, Guevara P, Ramirez J L

机构信息

Centro de Biología Celular, Universidad Central de Venezuela, Caracas.

出版信息

Mem Inst Oswaldo Cruz. 1992 Oct-Dec;87(4):517-23. doi: 10.1590/s0074-02761992000400009.

Abstract

A study of Trypanosomatidae GC distribution and codon usage is presented. The codon usage patterns in coincidence with the phylogenetical data are similar in Crithidia and Leishmania, whereas they are more divergent in Trypanosoma brucei and T. cruzi. The analysis of the GC mutational pressure in these organisms reveals that T. brucei, and to a lesser extent T. cruzi, have evolved towards a more balanced use of all bases, whereas Leishmania and Crithidia retain features of a primeval genetic apparatus. Tables with the approximated GC mutational pressure in homologous genes, and codon usage in Trypanosomatidae are presented.

摘要

本文展示了一项关于锥虫科GC分布和密码子使用情况的研究。与系统发育数据一致,克氏锥虫和利什曼原虫的密码子使用模式相似,而布氏锥虫和克氏锥虫的密码子使用模式差异更大。对这些生物体中GC突变压力的分析表明,布氏锥虫以及程度稍轻的克氏锥虫已朝着更均衡使用所有碱基的方向进化,而利什曼原虫和克氏锥虫保留了原始遗传机制的特征。文中给出了同源基因中近似GC突变压力以及锥虫科密码子使用情况的表格。

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