Suppr超能文献

Simpleaffy:一个用于Affymetrix质量控制和数据分析的生物导体软件包。

Simpleaffy: a BioConductor package for Affymetrix Quality Control and data analysis.

作者信息

Wilson Claire L, Miller Crispin J

机构信息

Paterson Institute for Cancer Research, Manchester M20 4BX, UK.

出版信息

Bioinformatics. 2005 Sep 15;21(18):3683-5. doi: 10.1093/bioinformatics/bti605. Epub 2005 Aug 2.

Abstract

UNLABELLED

Quality Control is a fundamental aspect of successful microarray data analysis. Simpleaffy is a BioConductor package that provides access to a variety of QC metrics for assessing the quality of RNA samples and of the intermediate stages of sample preparation and hybridization. Simpleaffy also offers fast implementations of popular algorithms for generating expression summaries and detection calls.

AVAILABILITY

Simpleaffy can be downloaded from http://www.bioconductor.org.

SUPPLEMENTARY INFORMATION

Additional information can be found on the supplementary website located at http://bioinformatics.picr.man.ac.uk.

摘要

未标注

质量控制是成功进行微阵列数据分析的一个基本方面。Simpleaffy是一个BioConductor软件包,它提供了各种质量控制指标,用于评估RNA样本以及样本制备和杂交中间阶段的质量。Simpleaffy还提供了用于生成表达汇总和检测调用的流行算法的快速实现。

可用性

可以从http://www.bioconductor.org下载Simpleaffy。

补充信息

更多信息可在位于http://bioinformatics.picr.man.ac.uk的补充网站上找到。

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