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水杨酸2-氨基-4,6-二甲基嘧啶鎓盐中的氢键和π-π相互作用。

Hydrogen-bonding and pi-pi interactions in 2-amino-4,6-dimethylpyrimidinium salicylate.

作者信息

Muthiah Packianathan Thomas, Balasubramani Kasthuri, Rychlewska Urszula, Plutecka Agnieszka

机构信息

School of Chemistry, Bharathidasan University, Tiruchirappalli 620 024, Tamilnadu, India.

出版信息

Acta Crystallogr C. 2006 Oct;62(Pt 10):o605-7. doi: 10.1107/S0108270106031015. Epub 2006 Sep 12.

Abstract

In the crystal structure of the title compound, C6H10N3+.C7H5O3-, the asymmetric unit contains four crystallographically independent 2-amino-4,6-dimethylpyrimidinium and salicylate ions (Z = 8). In each of these, one of the pyrimidine N atoms is protonated, and the carboxylate group of the salicylate ion interacts with the pyrimidine group through a pair of N-H...O hydrogen bonds, forming an R2(2)(8) motif. The pyrimidine cations also form base pairs via a pair of N-H...N hydrogen bonds (involving the amino group and the unprotonated ring N atom), forming another R2(2)(8) motif. Three such R2(2)(8) motifs, fused together, constitute a closed cyclic aggregate, and the linking of these aggregates, arranged in consecutive layers, can be analysed in terms of off-face stacking interactions.

摘要

在标题化合物C6H10N3+.C7H5O3-的晶体结构中,不对称单元包含四个晶体学独立的2-氨基-4,6-二甲基嘧啶鎓离子和水杨酸根离子(Z = 8)。在每一个中,嘧啶的一个N原子被质子化,水杨酸根离子的羧基通过一对N-H...O氢键与嘧啶基团相互作用,形成一个R2(2)(8)基序。嘧啶阳离子还通过一对N-H...N氢键(涉及氨基和未质子化的环N原子)形成碱基对,形成另一个R2(2)(8)基序。三个这样的R2(2)(8)基序融合在一起,构成一个封闭的环状聚集体,这些聚集体以连续层排列的连接方式可以根据非面对面堆积相互作用进行分析。

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