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BPSI2.0:通过调用 Matlab 引擎,使用 BP 神经网络的 C/C++接口程序,实现基于 DNA 条码的物种鉴定。

BPSI2.0: a C/C++ interface program for species identification via DNA barcoding with a BP-neural network by calling the Matlab engine.

机构信息

Albanova University Center, KTH - Royal Institute of Biotechnology, SE-106 91 Stockholm, Sweden.

出版信息

Mol Ecol Resour. 2009 Jan;9(1):104-6. doi: 10.1111/j.1755-0998.2008.02372.x. Epub 2008 Oct 7.

Abstract

BP-Species Identification (BPSI2.0) is a computer program that performs species identification by training a Back-Propagation Neural Network. A short DNA barcoding segment is used as input for training a three-layer BP network. The trained network can assign an unknown query sequence to a known species in the user's database, and provide the corresponding subvector value of the output vector as a relative probability value.

摘要

BP-Species Identification (BPSI2.0) 是一个通过训练反向传播神经网络来进行物种鉴定的计算机程序。一小段 DNA 条码序列被用作训练三层 BP 网络的输入。训练好的网络可以将未知的查询序列分配给用户数据库中的已知物种,并提供输出向量的相应子向量值作为相对概率值。

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