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桃疮痂病病原菌的基因组序列草图

Draft genome sequence of , the causal agent of peach scab.

作者信息

Chen Chunxian, Bock Clive H, Wood Bruce W

机构信息

USDA, Agricultural Research Service, Southeastern Fruit and Tree Nut Research Lab, 21 Dunbar Road, Byron, GA 31008 USA.

出版信息

Stand Genomic Sci. 2017 Dec 2;12:68. doi: 10.1186/s40793-017-0280-0. eCollection 2017.

DOI:10.1186/s40793-017-0280-0
PMID:29213355
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5712196/
Abstract

causes peach scab, a disease that renders peach () fruit unmarketable. We report a high-quality draft genome sequence (36.9 Mb) of from an isolate collected from a peach tree in central Georgia in the United States. The genome annotation is described and a phylogenetic analysis of the pathogen is presented. The genome sequence will be a useful resource for various studies on the pathogen, including the biology and ecology, taxonomy and phylogeny, host interaction and coevolution, isolation and characterization of genes of interest, and development of molecular markers for genotyping and mapping.

摘要

引发桃疮痂病,这种疾病会使桃子果实无法进入市场。我们报告了从美国佐治亚州中部一棵桃树上分离得到的[病原体名称]的高质量基因组草图序列(36.9 Mb)。描述了基因组注释并展示了该病原体的系统发育分析。该基因组序列将成为针对该病原体的各种研究的有用资源,包括生物学和生态学、分类学和系统发育、宿主相互作用和共同进化、感兴趣基因的分离和表征,以及用于基因分型和图谱绘制的分子标记开发。