• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一个 2',2'-二硫键桥联的二核苷酸构象锁定 RNA 发夹。

A 2',2'-disulfide-bridged dinucleotide conformationally locks RNA hairpins.

机构信息

IBMM, UMR 5247, Univ. Montpellier, CNRS, ENSCM, Montpellier, France.

出版信息

Org Biomol Chem. 2018 May 2;16(17):3181-3188. doi: 10.1039/c8ob00328a.

DOI:10.1039/c8ob00328a
PMID:29645048
Abstract

The synthesis and the impact of a disulfide bridge between 2'-O-positions of two adjacent nucleotides in an RNA duplex and in the loop of RNA hairpins are reported. The incorporation of this 2',2'-disulfide (S-S) bridge enabled thermal and enzymatic stabilization of the hairpin depending on its position in the loop. The influence of the disulfide bridge on RNA folding was studied at the HIV Dimerization Initiation Site (DIS) as an RNA sequence model. We have shown that this S-S bridge locked the hairpin form, whereas the extended duplex form was generated after the reduction of the disulfide bond in the presence of tris(2-carboxyethyl)phosphine or glutathione. Thus, the S-S bridge can be useful for understanding RNA folding; an RNA molecular beacon locked by an S-S bridge was also investigated as a sensor for the detection of glutathione.

摘要

报道了在 RNA 双链体的 2'-O-位置和 RNA 发夹环中相邻两个核苷酸之间形成二硫键(S-S)的合成及其影响。该 2',2'-二硫键(S-S)桥的引入能够根据其在环中的位置实现发夹结构的热稳定性和酶稳定性。该二硫键对 HIV 二聚化起始位点(DIS)中 RNA 折叠的影响作为 RNA 序列模型进行了研究。我们已经表明,该 S-S 桥锁定了发夹构象,而在三(2-羧乙基)膦或谷胱甘肽存在下还原二硫键后,会生成延伸的双链构象。因此,S-S 桥可用于理解 RNA 折叠;我们还研究了一种由 S-S 桥锁定的 RNA 分子信标作为谷胱甘肽检测的传感器。

相似文献

1
A 2',2'-disulfide-bridged dinucleotide conformationally locks RNA hairpins.一个 2',2'-二硫键桥联的二核苷酸构象锁定 RNA 发夹。
Org Biomol Chem. 2018 May 2;16(17):3181-3188. doi: 10.1039/c8ob00328a.
2
Synthesis and properties of RNA constrained by a 2'-O-disulfide bridge.2'-O- 二硫桥约束的 RNA 的合成与性质。
ChemistryOpen. 2024 Aug;13(8):e202300232. doi: 10.1002/open.202300232. Epub 2024 Jan 10.
3
Stabilization of double-stranded oligonucleotides using backbone-linked disulfide bridges.使用主链连接的二硫键桥来稳定双链寡核苷酸。
Nucleic Acids Res. 1995 Jan 25;23(2):285-92. doi: 10.1093/nar/23.2.285.
4
Fluorescent HIV-1 Dimerization Initiation Site: design, properties, and use for ligand discovery.荧光HIV-1二聚化起始位点:设计、特性及用于配体发现
J Am Chem Soc. 2007 Mar 21;129(11):3257-66. doi: 10.1021/ja0675797. Epub 2007 Feb 24.
5
Mechanism of hairpin-duplex conversion for the HIV-1 dimerization initiation site.HIV-1二聚化起始位点的发夹-双链转换机制
J Biol Chem. 2005 Dec 2;280(48):40112-21. doi: 10.1074/jbc.M503230200. Epub 2005 Sep 15.
6
Genome sequence analysis suggests coevolution of the DIS, SD, and Psi hairpins in HIV-1 genomes.基因组序列分析提示 DIS、SD 和 Psi 发夹结构在 HIV-1 基因组中共进化。
Virus Res. 2022 Nov;321:198910. doi: 10.1016/j.virusres.2022.198910. Epub 2022 Sep 5.
7
Crystal structures of coaxially stacked kissing complexes of the HIV-1 RNA dimerization initiation site.HIV-1 RNA二聚化起始位点同轴堆叠亲吻复合体的晶体结构
Nat Struct Biol. 2001 Dec;8(12):1064-8. doi: 10.1038/nsb727.
8
A quadruple mutant T4 RNA hairpin with the same structure as the wild-type translational repressor.一种具有与野生型翻译阻遏物相同结构的四重突变T4 RNA发夹。
Biochemistry. 1996 Jun 18;35(24):7675-83. doi: 10.1021/bi960415q.
9
Formation of dendrimeric RNA assemblies though RNA loop-loop interactions.通过RNA环-环相互作用形成树枝状RNA组装体。
Nucleic Acids Symp Ser (Oxf). 2004(48):97-8. doi: 10.1093/nass/48.1.97.
10
Bimodal loop-loop interactions increase the affinity of RNA aptamers for HIV-1 RNA structures.双峰环-环相互作用增加了RNA适体对HIV-1 RNA结构的亲和力。
Biochemistry. 2006 Feb 7;45(5):1518-24. doi: 10.1021/bi051187f.

引用本文的文献

1
Synthesis and properties of RNA constrained by a 2'-O-disulfide bridge.2'-O- 二硫桥约束的 RNA 的合成与性质。
ChemistryOpen. 2024 Aug;13(8):e202300232. doi: 10.1002/open.202300232. Epub 2024 Jan 10.
2
Conjugation of Doxorubicin to siRNA Through Disulfide-based Self-immolative Linkers.通过基于二硫键的自毁连接物将阿霉素与 siRNA 缀合。
Molecules. 2020 Jun 11;25(11):2714. doi: 10.3390/molecules25112714.