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从加纳可可中分离出的植物病原体菌株MS-2的杂交基因组序列草图。

Draft hybrid genome sequence of phytopathogen strain MS-2, isolated from cacao in Ghana.

作者信息

Yulfo-Soto Gabdiel E, Baruah Indrani K, Amoako-Attah Ishmael, Bukari Yahaya, Meinhardt Lyndel W, Bailey Bryan A, Cohen Stephen P

机构信息

U.S. Department of Agriculture-Agricultural Research Service, Sustainable Perennial Crops Laboratory, Beltsville, Maryland, USA.

Cocoa Research Institute of Ghana, Akim New-Tafo, Ghana.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2024 Oct 10;13(10):e0071424. doi: 10.1128/mra.00714-24. Epub 2024 Aug 30.

DOI:10.1128/mra.00714-24
PMID:39212352
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11465778/
Abstract

Here, we report a hybrid genome of strain MS-2, a cacao thread blight disease causing isolate that was collected from cacao leaves in Tafo, Eastern region, Ghana. The final assembly consists of 2,083 contigs spanning 69,843,039 bp, with 49.21% GC content, 92.6% BUSCO completeness, and scaffold N50 186,871.

摘要

在此,我们报告了菌株MS-2的混合基因组,该菌株是从加纳东部地区塔福的可可叶中分离得到的一种引起可可树白绢病的病原体。最终组装结果由2083个重叠群组成,跨度为69843039 bp,GC含量为49.21%,BUSCO完整性为92.6%,支架N50为186871。