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具有前所未有的桥连结构的新型硫肽类化合物诺卡肽的异源生物合成:硫醚氨酸和 3-羟基-β-丙氨酸。

Heterologous Biosynthesis of New Lanthipeptides Nocardiopeptins with an Unprecedented Bridging Pattern of Lanthionine and Labionin.

机构信息

Graduate School of Integrated Science and Technology, Shizuoka University, Shizuoka 422-8529, Japan.

College of Agriculture, Academic Institute, Shizuoka University, Shizuoka 422-8529, Japan.

出版信息

ACS Chem Biol. 2024 Sep 20;19(9):1896-1903. doi: 10.1021/acschembio.4c00266. Epub 2024 Sep 9.

DOI:10.1021/acschembio.4c00266
PMID:39248435
Abstract

The class III lanthipeptide synthetase (LanKC) installs unusual amino acids, such as lanthionine and labionin, in lanthipeptides. Through genome mining, we discovered a new class III lanthipeptide synthetase coding gene () and precursor peptide coding genes (, , and ) in the genome of the actinobacterium . Coexpression experiments of the biosynthetic genes in resulted in the production of new lanthipeptides named nocardiopeptins A1-A3. Analysis of two-dimensional NMR spectra after enzymatic degradation and partial basic hydrolysis of nocardiopeptin A2 revealed that labionin was located in lanthionine with opposite orientations, forming a nesting structure in nocardiopeptin A2. To the best of our knowledge, this bridging pattern in the lanthipeptides was unprecedented, indicating a novel reaction characteristic of the class III lanthipeptide synthetase NptKC.

摘要

III 类硫肽合成酶(LanKC)在硫肽中安装不寻常的氨基酸,如硫氨酸和拉宾宁。通过基因组挖掘,我们在放线菌的基因组中发现了一个新的 III 类硫肽合成酶编码基因()和前体肽编码基因(、、和)。在中表达生物合成基因的共表达实验导致了新的硫肽nocardiopeptins A1-A3 的产生。nocardiopeptin A2 的酶解和部分碱性水解后的二维 NMR 谱分析表明,拉宾宁位于硫氨酸的相反方向,在 nocardiopeptin A2 中形成嵌套结构。据我们所知,这种硫肽中的桥接模式是前所未有的,表明 III 类硫肽合成酶 NptKC 的新反应特征。

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