• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一个基于系统命名法的可通过互联网访问的小鼠发育解剖学数据库。

An internet-accessible database of mouse developmental anatomy based on a systematic nomenclature.

作者信息

Bard J L, Kaufman M H, Dubreuil C, Brune R M, Burger A, Baldock R A, Davidson D R

机构信息

Centre for Developmental Biology and Department of Anatomy, Medical School, Edinburgh University, UK.

出版信息

Mech Dev. 1998 Jun;74(1-2):111-20. doi: 10.1016/s0925-4773(98)00069-0.

DOI:10.1016/s0925-4773(98)00069-0
PMID:9651497
Abstract

This paper reports an internet-accessible database of mouse developmental anatomy (DMDA) that currently holds a hierarchy of the names and synonyms of the tissues in the first 22 Theiler stages of development (E1-E13.5), together with other appropriate information. The purposes of the database are to provide, first, a nomenclature for analyzing normal and mutant mouse anatomy, and second a language for inputting, storing and querying gene-expression and other spatially organized data. DMDA currently contains some 6900 named and staged tissues (e.g. 360 and 1161 tissues in Theiler stage (TS) 14 (E9) and TS22 (E13.5) embryos). DMDA will be extended to include further lineage and other data when it becomes available. The database can be interactively accessed over the internet using either a Java or a non-Java WWW browser at http://genex.hgu.mrc.ac.uk/.

摘要

本文报告了一个可通过互联网访问的小鼠发育解剖学数据库(DMDA),该数据库目前保存了发育的前22个泰勒阶段(E1 - E13.5)组织的名称和同义词层次结构,以及其他相关信息。该数据库的目的,一是为分析正常和突变小鼠解剖结构提供一种命名法,二是为输入、存储和查询基因表达及其他空间组织数据提供一种语言。DMDA目前包含约6900个命名和分期的组织(例如,泰勒阶段(TS)14(E9)和TS22(E13.5)胚胎中的360个和1161个组织)。当有更多谱系和其他数据可用时,DMDA将进行扩展以纳入这些数据。可使用Java或非Java的万维网浏览器通过互联网在http://genex.hgu.mrc.ac.uk/上交互式访问该数据库。

相似文献

1
An internet-accessible database of mouse developmental anatomy based on a systematic nomenclature.一个基于系统命名法的可通过互联网访问的小鼠发育解剖学数据库。
Mech Dev. 1998 Jun;74(1-2):111-20. doi: 10.1016/s0925-4773(98)00069-0.
2
An ontology of human developmental anatomy.人类发育解剖学本体论。
J Anat. 2003 Oct;203(4):347-55. doi: 10.1046/j.1469-7580.2003.00224.x.
3
A three-dimensional model of the mouse at embryonic day 9.胚胎第9天小鼠的三维模型。
Dev Biol. 1999 Dec 15;216(2):457-68. doi: 10.1006/dbio.1999.9500.
4
Formalization of mouse embryo anatomy.小鼠胚胎解剖学的形式化。
Bioinformatics. 2004 Jan 22;20(2):259-67. doi: 10.1093/bioinformatics/btg400.
5
EMAGE--Edinburgh Mouse Atlas of Gene Expression: 2008 update.EMAGE——爱丁堡小鼠基因表达图谱:2008年更新版。
Nucleic Acids Res. 2008 Jan;36(Database issue):D860-5. doi: 10.1093/nar/gkm938. Epub 2007 Dec 12.
6
EMAGE: a spatial database of gene expression patterns during mouse embryo development.EMAGE:小鼠胚胎发育过程中基因表达模式的空间数据库。
Nucleic Acids Res. 2006 Jan 1;34(Database issue):D637-41. doi: 10.1093/nar/gkj006.
7
Three-dimensional digital mouse atlas using high-resolution MRI.使用高分辨率磁共振成像的三维数字小鼠图谱。
Dev Biol. 2001 Apr 15;232(2):458-70. doi: 10.1006/dbio.2001.0189.
8
Computer-based three-dimensional visualization of developmental gene expression.基于计算机的发育基因表达三维可视化。
Nat Genet. 2000 Jun;25(2):147-52. doi: 10.1038/75989.
9
The Kidney Development Database.肾脏发育数据库。
Dev Genet. 1999;24(3-4):194-8. doi: 10.1002/(SICI)1520-6408(1999)24:3/4<194::AID-DVG2>3.0.CO;2-V.
10
The BioMart interface to the eMouseAtlas gene expression database EMAGE.eMouseAtlas 基因表达数据库 EMAGE 的 Biomart 接口。
Database (Oxford). 2011 Sep 18;2011:bar029. doi: 10.1093/database/bar029. Print 2011.

引用本文的文献

1
Uncovering developmental time and tempo using deep learning.利用深度学习揭示发育时间和节奏。
Nat Methods. 2023 Dec;20(12):2000-2010. doi: 10.1038/s41592-023-02083-8. Epub 2023 Nov 23.
2
Bridging mouse and human anatomies; a knowledge-based approach to comparative anatomy for disease model phenotyping.桥接鼠和人解剖结构;基于知识的比较解剖学方法用于疾病模型表型分析。
Mamm Genome. 2023 Sep;34(3):389-407. doi: 10.1007/s00335-023-10005-4. Epub 2023 Jul 8.
3
Leveraging three-dimensional chromatin architecture for effective reconstruction of enhancer-target gene regulatory interactions.
利用三维染色质结构有效重建增强子-靶基因调控相互作用。
Nucleic Acids Res. 2021 Sep 27;49(17):e97. doi: 10.1093/nar/gkab547.
4
Constructing the rodent stereotaxic brain atlas: a survey.构建啮齿动物立体定向脑图谱:调查。
Sci China Life Sci. 2022 Jan;65(1):93-106. doi: 10.1007/s11427-020-1911-9. Epub 2021 Apr 13.
5
Mid-Gestation lethality of -Ablated Mice.中孕期 -Ablated 小鼠的致死性。
Int J Mol Sci. 2020 Jul 20;21(14):5124. doi: 10.3390/ijms21145124.
6
Nrf2 Induction Re-establishes a Proper Neuronal Differentiation Program in Friedreich's Ataxia Neural Stem Cells.Nrf2诱导在弗里德赖希共济失调神经干细胞中重新建立适当的神经元分化程序。
Front Cell Neurosci. 2019 Jul 31;13:356. doi: 10.3389/fncel.2019.00356. eCollection 2019.
7
Selective Constraints on Coding Sequences of Nervous System Genes Are a Major Determinant of Duplicate Gene Retention in Vertebrates.神经系统基因编码序列的选择性限制是脊椎动物中重复基因保留的主要决定因素。
Mol Biol Evol. 2017 Nov 1;34(11):2773-2791. doi: 10.1093/molbev/msx199.
8
Searching the Mouse Genome Informatics (MGI) Resources for Information on Mouse Biology from Genotype to Phenotype.在小鼠基因组信息学(MGI)资源中搜索从基因型到表型的小鼠生物学信息。
Curr Protoc Bioinformatics. 2016 Dec 8;56:1.7.1-1.7.16. doi: 10.1002/cpbi.18.
9
Sam68 promotes self-renewal and glycolytic metabolism in mouse neural progenitor cells by modulating pre-mRNA 3'-end processing.Sam68通过调节前体mRNA 3'末端加工来促进小鼠神经祖细胞的自我更新和糖酵解代谢。
Elife. 2016 Nov 15;5:e20750. doi: 10.7554/eLife.20750.
10
Muscle Logic: New Knowledge Resource for Anatomy Enables Comprehensive Searches of the Literature on the Feeding Muscles of Mammals.肌肉逻辑:解剖学新知识资源助力全面检索哺乳动物进食肌肉相关文献。
PLoS One. 2016 Feb 12;11(2):e0149102. doi: 10.1371/journal.pone.0149102. eCollection 2016.