• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

从全局表达数据到基因网络。

From global expression data to gene networks.

作者信息

Thieffry D

机构信息

Unité de Bioinformatique, IBMM-ULB, 12 rue des Professeurs Jeener et Brachet, B-6041 Gosselies, Belgium.

出版信息

Bioessays. 1999 Nov;21(11):895-9. doi: 10.1002/(SICI)1521-1878(199911)21:11<895::AID-BIES1>3.0.CO;2-F.

DOI:10.1002/(SICI)1521-1878(199911)21:11<895::AID-BIES1>3.0.CO;2-F
PMID:10517862
Abstract

Allowing the parallel monitoring of the transcription of thousands of genes, microarrays constitute a powerful technique for functional genomics. In a recent paper, a clustering method and a local alignment software were combined to identify DNA motifs in sets of yeast genes endowed with similar transcription profiles throughout mitosis (1). Identifying various known transcriptional binding sites together with new putative ones, the authors made a significant step towards a systematic characterization of the regulatory structure of genomic networks. BioEssays 1999;21:895-899.

摘要

微阵列技术能够同时监测数千个基因的转录情况,是功能基因组学研究中的一项强大技术。在最近的一篇论文中,一种聚类方法与一款局部比对软件相结合,用于在整个有丝分裂过程中具有相似转录谱的酵母基因集中识别DNA基序(1)。作者识别出了各种已知的转录结合位点以及新的假定结合位点,朝着系统表征基因组网络调控结构迈出了重要一步。《生物论文》1999年;21卷:895 - 899页 。

相似文献

1
From global expression data to gene networks.从全局表达数据到基因网络。
Bioessays. 1999 Nov;21(11):895-9. doi: 10.1002/(SICI)1521-1878(199911)21:11<895::AID-BIES1>3.0.CO;2-F.
2
Genome-wide prediction of transcriptional regulatory elements of human promoters using gene expression and promoter analysis data.利用基因表达和启动子分析数据对人类启动子的转录调控元件进行全基因组预测。
BMC Bioinformatics. 2006 Jul 4;7:330. doi: 10.1186/1471-2105-7-330.
3
[Estimating coarse gene networks from yeast gene expression time series].[从酵母基因表达时间序列估计粗略基因网络]
Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao (Shanghai). 2003 Aug;35(8):707-16.
4
Detecting biological associations between genes based on the theory of phase synchronization.基于相位同步理论检测基因之间的生物学关联。
Biosystems. 2008 May;92(2):99-113. doi: 10.1016/j.biosystems.2007.12.006. Epub 2008 Jan 11.
5
Beyond synexpression relationships: local clustering of time-shifted and inverted gene expression profiles identifies new, biologically relevant interactions.超越共表达关系:时移和反向基因表达谱的局部聚类可识别新的生物学相关相互作用。
J Mol Biol. 2001 Dec 14;314(5):1053-66. doi: 10.1006/jmbi.2000.5219.
6
Computer-assisted identification of cell cycle-related genes: new targets for E2F transcription factors.细胞周期相关基因的计算机辅助鉴定:E2F转录因子的新靶点
J Mol Biol. 2001 May 25;309(1):99-120. doi: 10.1006/jmbi.2001.4650.
7
Regulatory motif finding by logic regression.通过逻辑回归进行调控基序发现。
Bioinformatics. 2004 Nov 1;20(16):2799-811. doi: 10.1093/bioinformatics/bth333. Epub 2004 May 27.
8
Location analysis of DNA-bound proteins at the whole-genome level: untangling transcriptional regulatory networks.全基因组水平上DNA结合蛋白的定位分析:解析转录调控网络
Bioessays. 2001 Jun;23(6):473-6. doi: 10.1002/bies.1066.
9
A mathematical and computational framework for quantitative comparison and integration of large-scale gene expression data.用于大规模基因表达数据定量比较与整合的数学和计算框架。
Nucleic Acids Res. 2005 May 10;33(8):2580-94. doi: 10.1093/nar/gki536. Print 2005.
10
[Gene-expression analysis using DNA microarrays].[使用DNA微阵列进行基因表达分析]
Ned Tijdschr Geneeskd. 2002 Oct 5;146(40):1867-73.

引用本文的文献

1
A DSRPCL-SVM approach to informative gene analysis.一种用于信息基因分析的DSRPCL-SVM方法。
Genomics Proteomics Bioinformatics. 2008 Jun;6(2):83-90. doi: 10.1016/S1672-0229(08)60023-6.
2
Serial analysis of gene expression identifies metallothionein-II as major neuroprotective gene in mouse focal cerebral ischemia.基因表达序列分析确定金属硫蛋白-II为小鼠局灶性脑缺血中的主要神经保护基因。
J Neurosci. 2002 Jul 15;22(14):5879-88. doi: 10.1523/JNEUROSCI.22-14-05879.2002.