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寡核苷酸标记:一种新型自旋标记2'-脱氧鸟苷类似物的合成

Oligonucleotide labeling: synthesis of a new spin-labeled 2'-deoxyguanosine analogue.

作者信息

Giordano C, Pedone F, Fattibene P, Cellai L

机构信息

Centro di Chimica del Farmaco, CNR, Dipartimento di Studi Farmaceutici, Università La Sapienza, Rome, Italy.

出版信息

Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2000 Aug;19(8):1301-10. doi: 10.1080/15257770008033053.

DOI:10.1080/15257770008033053
PMID:11097060
Abstract

In order to achieve an EPR sensitive probe for DNA, 3-carboxy-Proxyl free radical was linked to O-6 of dG through a five-atoms-tether. The modified base was incorporated into a 30-mer ODN, then annealed to its complementary DNA strand. Hydrodynamic parameters show only a slight destabilization with respect to the equivalent unlabeled hybrid. EPR could monitor the hybrid formation showing a progressive enlargement of the upfield signal in passing from the labeled ss- to the ds-30-mer.

摘要

为了获得一种对DNA具有电子顺磁共振(EPR)敏感性的探针,将3-羧基-脯氨酰自由基通过一个五原子连接链连接到dG的O-6位上。将修饰后的碱基掺入到一条30个碱基的寡脱氧核苷酸(ODN)中,然后与它的互补DNA链退火。流体动力学参数表明,相对于等效的未标记杂交体,其稳定性仅有轻微下降。EPR能够监测杂交体的形成,从标记的单链30聚体到双链30聚体的过程中,EPR信号的上场信号逐渐增大。

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Beilstein J Org Chem. 2021 Feb 11;17:410-419. doi: 10.3762/bjoc.17.37. eCollection 2021.