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ANTHEPROT:一款具有客户端/服务器功能的集成蛋白质序列分析软件。

ANTHEPROT: an integrated protein sequence analysis software with client/server capabilities.

作者信息

Deléage G, Combet C, Blanchet C, Geourjon C

机构信息

Pôle Bioinformatique Lyonnais, Institut de Biologie et Chimie des Protéines, CNRS UMR 5086 Bioinformatique et RMN structurales, 7, Passage du Vercors, 69 367 Lyon, Cedex 07, France.

出版信息

Comput Biol Med. 2001 Jul;31(4):259-67. doi: 10.1016/s0010-4825(01)00008-7.

DOI:10.1016/s0010-4825(01)00008-7
PMID:11334635
Abstract

Programs devoted to the analysis of protein sequences exist either as stand-alone programs or as Web servers. However, stand-alone programs can hardly accommodate for the analysis that involves comparisons on databanks, which require regular updates. Moreover, Web servers cannot be as efficient as stand-alone programs when dealing with real-time graphic display. We describe here a stand-alone software program called ANTHEPROT, which is intended to perform protein sequence analysis with a high integration level and clients/server capabilities. It is an interactive program with a graphical user interface that allows handling of protein sequence and data in a very interactive and convenient manner. It provides many methods and tools, which are integrated into a graphical user interface. ANTHEPROT is available for Windows-based systems. It is able to connect to a Web server in order to perform large-scale sequence comparison on up-to-date databanks. ANTHEPROT is freely available to academic users and may be downloaded at http://pbil.ibcp.fr/ANTHEPROT.

摘要

专门用于蛋白质序列分析的程序有独立程序和网络服务器两种形式。然而,独立程序很难适应涉及数据库比较的分析,因为数据库需要定期更新。此外,在处理实时图形显示时,网络服务器不如独立程序高效。我们在此描述一个名为ANTHEPROT的独立软件程序,它旨在以高度集成的水平和客户端/服务器功能进行蛋白质序列分析。它是一个带有图形用户界面的交互式程序,允许以非常交互式和方便的方式处理蛋白质序列和数据。它提供了许多方法和工具,并集成到图形用户界面中。ANTHEPROT适用于基于Windows的系统。它能够连接到网络服务器,以便在最新的数据库上进行大规模序列比较。学术用户可以免费使用ANTHEPROT,可从http://pbil.ibcp.fr/ANTHEPROT下载。

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