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蛋白质家族中氢键特征模式的检测。

Detection of hydrogen-bond signature patterns in protein families.

作者信息

Prasad Tejasvini, Prathima M N, Chandra Nagasuma

机构信息

Bioinformatics Centre, Supercomputer Education and Research Centre, Indian Institute of Science, Bangalore 560012, India.

出版信息

Bioinformatics. 2003 Jan;19(1):167-8. doi: 10.1093/bioinformatics/19.1.167.

DOI:10.1093/bioinformatics/19.1.167
PMID:12499314
Abstract

SUMMARY

We have developed a WWW server, HBPRINT, for the identification of hydrogen-bond signature patterns in protein families from their structures. The server calculates (a) common hydrogen bonds between two structures (b) a hydrogen-bond fingerprint in a set of structural neighbours and (c) details of conserved hydrogen bonds. The server also enables the visualization of the hydrogen bond network comprising the signature pattern.

AVAILABILITY

HBPRINT and a tutorial are available from http://144.16.93.115/hb_page/index.html.

摘要

摘要

我们开发了一个万维网服务器HBPRINT，用于从蛋白质家族的结构中识别氢键特征模式。该服务器可计算：（a）两个结构之间的共有氢键；（b）一组结构邻域中的氢键指纹；以及（c）保守氢键的详细信息。该服务器还能可视化包含特征模式的氢键网络。

可用性

可从http://144.16.93.115/hb_page/index.html获取HBPRINT及教程。

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引用本文的文献

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