• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

2HAPI:一种微阵列数据分析系统。

2HAPI: a microarray data analysis system.

作者信息

Fink J Lynn, Drewes Scott, Patel Hiren, Welsh John B, Masys Daniel R, Corbeil Jacques, Gribskov Michael

机构信息

San Diego Supercomputer Center, Department of Biology, University of California, San Diego, 9500 Gilman Drive, San Diego, CA 92093-0537, USA.

出版信息

Bioinformatics. 2003 Jul 22;19(11):1443-5. doi: 10.1093/bioinformatics/btg169.

DOI:10.1093/bioinformatics/btg169
PMID:12874061
Abstract

SUMMARY

2HAPI (version 2 of High density Array Pattern Interpreter) is a web-based, publicly-available analytical tool designed to aid researchers in microarray data analysis. 2HAPI includes tools for searching, manipulating, visualizing, and clustering the large sets of data generated by microarray experiments. Other features include association of genes with NCBI information and linkage to external data resources. Unique to 2HAPI is the ability to retrieve upstream sequences of co-regulated genes for promoter analysis using MEME (Multiple Expectation-maximization for Motif Elicitation)

AVAILABILITY

2HAPI is freely available at http://array.sdsc.edu. Users can try 2HAPI anonymously with pre-loaded data or they can register as a 2HAPI user and upload their data.

摘要

摘要

2HAPI(高密度阵列模式解释器版本2)是一个基于网络的、公开可用的分析工具,旨在帮助研究人员进行微阵列数据分析。2HAPI包括用于搜索、处理、可视化和聚类微阵列实验产生的大量数据的工具。其他功能包括将基因与NCBI信息相关联以及链接到外部数据资源。2HAPI的独特之处在于能够检索共调控基因的上游序列,以便使用MEME(用于基序引出的多重期望最大化)进行启动子分析。

可用性

2HAPI可在http://array.sdsc.edu免费获取。用户可以使用预加载的数据以匿名方式试用2HAPI,也可以注册成为2HAPI用户并上传自己的数据。

相似文献

1
2HAPI: a microarray data analysis system.2HAPI:一种微阵列数据分析系统。
Bioinformatics. 2003 Jul 22;19(11):1443-5. doi: 10.1093/bioinformatics/btg169.
2
DNMAD: web-based diagnosis and normalization for microarray data.DNMAD:基于网络的微阵列数据诊断与标准化
Bioinformatics. 2004 Dec 12;20(18):3656-8. doi: 10.1093/bioinformatics/bth401. Epub 2004 Jul 9.
3
AVA: visual analysis of gene expression microarray data.AVA:基因表达微阵列数据的可视化分析
Bioinformatics. 2003 Jan 22;19(2):293-4. doi: 10.1093/bioinformatics/19.2.293.
4
Gene expression data preprocessing.基因表达数据预处理。
Bioinformatics. 2003 Mar 22;19(5):655-6. doi: 10.1093/bioinformatics/btg040.
5
SeqExpress: desktop analysis and visualization tool for gene expression experiments.SeqExpress:用于基因表达实验的桌面分析和可视化工具。
Bioinformatics. 2004 Jul 10;20(10):1649-50. doi: 10.1093/bioinformatics/bth123. Epub 2004 Feb 26.
6
SNOMAD (Standardization and NOrmalization of MicroArray Data): web-accessible gene expression data analysis.SNOMAD(微阵列数据标准化与归一化):基于网络的基因表达数据分析
Bioinformatics. 2002 Nov;18(11):1540-1. doi: 10.1093/bioinformatics/18.11.1540.
7
MatArray: a Matlab toolbox for microarray data.MatArray:一个用于微阵列数据的Matlab工具箱。
Bioinformatics. 2003 Mar 22;19(5):659-60. doi: 10.1093/bioinformatics/btg046.
8
PGAGENE: integrating quantitative gene-specific results from the NHLBI programs for genomic applications.PGAGENE:整合美国国立心肺血液研究所基因组应用项目的定量基因特异性结果。
Bioinformatics. 2003 Apr 12;19(6):778-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btg066.
9
Analyzing microarray data using CLANS.使用CLANS分析微阵列数据。
Bioinformatics. 2007 May 1;23(9):1170-1. doi: 10.1093/bioinformatics/btm079. Epub 2007 Mar 7.
10
Biosphere: the interoperation of web services in microarray cluster analysis.生物群落:微阵列聚类分析中网络服务的互操作。
Appl Bioinformatics. 2004;3(4):253-6. doi: 10.2165/00822942-200403040-00007.