• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

通过迭代数据细化实现三维电子显微镜中的传递函数恢复

Transfer function restoration in 3D electron microscopy via iterative data refinement.

作者信息

Sorzano C O S, Marabini R, Herman G T, Censor Y, Carazo J M

机构信息

Escuela Politécnica Superior, Universidad San Pablo-CEU, Campus Urb Montepríncipe, s/n, 28668 Boadilla del Monte, Madrid, Spain.

出版信息

Phys Med Biol. 2004 Feb 21;49(4):509-22. doi: 10.1088/0031-9155/49/4/003.

DOI:10.1088/0031-9155/49/4/003
PMID:15005161
Abstract

Three-dimensional electron microscopy (3D-EM) is a powerful tool for visualizing complex biological systems. As with any other imaging device, the electron microscope introduces a transfer function (called in this field the contrast transfer function, CTF) into the image acquisition process that modulates the various frequencies of the signal. Thus, the 3D reconstructions performed with these CTF-affected projections are also affected by an implicit 3D transfer function. For high-resolution electron microscopy, the effect of the CTF is quite dramatic and limits severely the achievable resolution. In this work we make use of the iterative data refinement (IDR) technique to ameliorate the effect of the CTF. It is demonstrated that the approach can be successfully applied to noisy data.

摘要

三维电子显微镜(3D-EM)是用于可视化复杂生物系统的强大工具。与任何其他成像设备一样,电子显微镜在图像采集过程中引入了一个传递函数(在该领域称为对比度传递函数,CTF),该函数调制信号的各种频率。因此,用这些受CTF影响的投影进行的三维重建也受到隐式三维传递函数的影响。对于高分辨率电子显微镜,CTF的影响相当显著,并严重限制了可实现的分辨率。在这项工作中,我们利用迭代数据细化(IDR)技术来改善CTF的影响。结果表明,该方法可以成功应用于噪声数据。

相似文献

1
Transfer function restoration in 3D electron microscopy via iterative data refinement.通过迭代数据细化实现三维电子显微镜中的传递函数恢复
Phys Med Biol. 2004 Feb 21;49(4):509-22. doi: 10.1088/0031-9155/49/4/003.
2
A method for estimating the CTF in electron microscopy based on ARMA models and parameter adjustment.一种基于自回归滑动平均(ARMA)模型和参数调整的电子显微镜中对比度传递函数(CTF)估计方法。
Ultramicroscopy. 2003 Jul;96(1):17-35. doi: 10.1016/S0304-3991(02)00377-7.
3
Visualization and quality assessment of the contrast transfer function estimation.对比度传递函数估计的可视化与质量评估。
J Struct Biol. 2015 Nov;192(2):222-34. doi: 10.1016/j.jsb.2015.06.012. Epub 2015 Jun 12.
4
A multiresolution approach to orientation assignment in 3D electron microscopy of single particles.单颗粒三维电子显微镜中取向分配的多分辨率方法。
J Struct Biol. 2004 Jun;146(3):381-92. doi: 10.1016/j.jsb.2004.01.006.
5
Spline-based image-to-volume registration for three-dimensional electron microscopy.用于三维电子显微镜的基于样条的图像到体积配准
Ultramicroscopy. 2005 Jul;103(4):303-17. doi: 10.1016/j.ultramic.2005.02.002. Epub 2005 Mar 11.
6
Rotational and translational alignment errors in 3D reconstruction of virus structures at high resolution.高分辨率病毒结构三维重建中的旋转和平移对准误差。
Int J Bioinform Res Appl. 2006;2(4):359-70. doi: 10.1504/IJBRA.2006.011035.
7
CTF Challenge: Result summary.CTF 挑战:结果总结。
J Struct Biol. 2015 Jun;190(3):348-59. doi: 10.1016/j.jsb.2015.04.003. Epub 2015 Apr 23.
8
Error analysis in the determination of the electron microscopical contrast transfer function parameters from experimental power Spectra.从实验功率谱确定电子显微镜对比度传递函数参数中的误差分析。
BMC Struct Biol. 2009 Mar 26;9:18. doi: 10.1186/1472-6807-9-18.
9
Unraveling the structure of membrane proteins in situ by transfer function corrected cryo-electron tomography.通过传递函数校正的冷冻电镜断层成像技术解析原位的膜蛋白结构。
J Struct Biol. 2012 Dec;180(3):488-96. doi: 10.1016/j.jsb.2012.09.008. Epub 2012 Sep 18.
10
Fast, robust, and accurate determination of transmission electron microscopy contrast transfer function.快速、稳健且准确地测定透射电子显微镜的对比度传递函数。
J Struct Biol. 2007 Nov;160(2):249-62. doi: 10.1016/j.jsb.2007.08.013. Epub 2007 Aug 29.

引用本文的文献

1
Development of basic building blocks for cryo-EM: the emcore and emvis software libraries.开发用于冷冻电镜的基本构建模块:emcore 和 emvis 软件库。
Acta Crystallogr D Struct Biol. 2020 Apr 1;76(Pt 4):350-356. doi: 10.1107/S2059798320003769. Epub 2020 Mar 31.
2
Error analysis in the determination of the electron microscopical contrast transfer function parameters from experimental power Spectra.从实验功率谱确定电子显微镜对比度传递函数参数中的误差分析。
BMC Struct Biol. 2009 Mar 26;9:18. doi: 10.1186/1472-6807-9-18.
3
Image processing for electron microscopy single-particle analysis using XMIPP.
使用XMIPP进行电子显微镜单颗粒分析的图像处理
Nat Protoc. 2008;3(6):977-90. doi: 10.1038/nprot.2008.62.
4
3D electron microscopy of biological nanomachines: principles and applications.生物纳米机器的三维电子显微镜:原理与应用
Eur Biophys J. 2007 Nov;36(8):995-1013. doi: 10.1007/s00249-007-0203-x. Epub 2007 Jul 5.