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EMBLSCAN:在光盘上进行快速近似DNA数据库搜索。

EMBLSCAN: fast approximate DNA database searches on compact disc.

作者信息

Higgins D G, Stoehr P

机构信息

European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg, FRG.

出版信息

Comput Appl Biosci. 1992 Apr;8(2):137-9. doi: 10.1093/bioinformatics/8.2.137.

DOI:10.1093/bioinformatics/8.2.137
PMID:1591608
Abstract

An algorithm that allows rapid searching of nucleic acid sequences based on pregenerated index files is described. The programs and index files for searching the entire EMBL nucleotide sequence collection are being distributed on the EMBL Data Library's CD-ROM.

摘要

本文描述了一种基于预先生成的索引文件快速搜索核酸序列的算法。用于搜索整个EMBL核苷酸序列集的程序和索引文件正在EMBL数据库的光盘上发行。

相似文献

1
EMBLSCAN: fast approximate DNA database searches on compact disc.EMBLSCAN:在光盘上进行快速近似DNA数据库搜索。
Comput Appl Biosci. 1992 Apr;8(2):137-9. doi: 10.1093/bioinformatics/8.2.137.
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EMBL-search: a CD-ROM based database query system.欧洲分子生物学实验室搜索:一个基于光盘的数据库查询系统。
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The European Bioinformatics Institute (EBI) databases.欧洲生物信息学研究所(EBI)数据库。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):6-12. doi: 10.1093/nar/24.1.6.
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The EMBL Nucleotide Sequence Database.欧洲分子生物学实验室核苷酸序列数据库。
Nucleic Acids Res. 1997 Jan 1;25(1):7-14. doi: 10.1093/nar/25.1.7.
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Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3445-9. doi: 10.1093/nar/22.17.3445.
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The EMBL nucleotide sequence database.欧洲分子生物学实验室核苷酸序列数据库。
Nucleic Acids Res. 1998 Jan 1;26(1):8-15. doi: 10.1093/nar/26.1.8.
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10
The EMBL Nucleotide Sequence Database.欧洲分子生物学实验室核苷酸序列数据库。
Nucleic Acids Res. 1999 Jan 1;27(1):18-24. doi: 10.1093/nar/27.1.18.

引用本文的文献

1
The EMBL data library.欧洲分子生物学实验室数据库
Nucleic Acids Res. 1993 Jul 1;21(13):2967-71. doi: 10.1093/nar/21.13.2967.
2
The European Bioinformatics Institute (EBI) databases.欧洲生物信息学研究所(EBI)数据库。
Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3445-9. doi: 10.1093/nar/22.17.3445.