• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

CTD功能的结构视角。

A structural perspective of CTD function.

作者信息

Meinhart Anton, Kamenski Tomislav, Hoeppner Sabine, Baumli Sonja, Cramer Patrick

机构信息

Department of Chemistry and Biochemistry, Gene Center, University of Munich (LMU), 81377 Munich, Germany.

出版信息

Genes Dev. 2005 Jun 15;19(12):1401-15. doi: 10.1101/gad.1318105.

DOI:10.1101/gad.1318105
PMID:15964991
Abstract

The C-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II (Pol II) integrates nuclear events by binding proteins involved in mRNA biogenesis. CTD-binding proteins recognize a specific CTD phosphorylation pattern, which changes during the transcription cycle, due to the action of CTD-modifying enzymes. Structural and functional studies of CTD-binding and -modifying proteins now reveal some of the mechanisms underlying CTD function. Proteins recognize CTD phosphorylation patterns either directly, by contacting phosphorylated residues, or indirectly, without contact to the phosphate. The catalytic mechanisms of CTD kinases and phosphatases are known, but the basis for CTD specificity of these enzymes remains to be understood.

摘要

RNA聚合酶II(Pol II)的C末端结构域(CTD)通过与参与mRNA生物合成的蛋白质结合来整合核内事件。CTD结合蛋白识别特定的CTD磷酸化模式,由于CTD修饰酶的作用,这种模式在转录周期中会发生变化。目前,对CTD结合蛋白和修饰蛋白的结构与功能研究揭示了一些CTD功能的潜在机制。蛋白质通过接触磷酸化残基直接识别CTD磷酸化模式,或者不接触磷酸基团间接识别。CTD激酶和磷酸酶的催化机制已为人所知,但这些酶对CTD的特异性基础仍有待了解。

相似文献

1
A structural perspective of CTD function.CTD功能的结构视角。
Genes Dev. 2005 Jun 15;19(12):1401-15. doi: 10.1101/gad.1318105.
2
Recognition of RNA polymerase II carboxy-terminal domain by 3'-RNA-processing factors.3'-RNA加工因子对RNA聚合酶II羧基末端结构域的识别。
Nature. 2004 Jul 8;430(6996):223-6. doi: 10.1038/nature02679.
3
Enhanced binding of RNAP II CTD phosphatase FCP1 to RAP74 following CK2 phosphorylation.CK2磷酸化后,RNA聚合酶II C末端结构域磷酸酶FCP1与RAP74的结合增强。
Biochemistry. 2005 Mar 1;44(8):2732-45. doi: 10.1021/bi047958h.
4
An encephalitozoon cuniculi ortholog of the RNA polymerase II carboxyl-terminal domain (CTD) serine phosphatase Fcp1.兔脑炎微孢子虫中RNA聚合酶II羧基末端结构域(CTD)丝氨酸磷酸酶Fcp1的直系同源物。
Biochemistry. 2004 Jun 8;43(22):7111-20. doi: 10.1021/bi0499617.
5
Assaying CTD kinases in vitro and phosphorylation-modulated properties of RNA polymerase II in vivo.体外测定CTD激酶及体内RNA聚合酶II的磷酸化调节特性。
Methods. 1997 Jul;12(3):264-75. doi: 10.1006/meth.1997.0478.
6
Arabidopsis C-terminal domain phosphatase-like 1 and 2 are essential Ser-5-specific C-terminal domain phosphatases.拟南芥C端结构域类磷酸酶1和2是必需的丝氨酸5特异性C端结构域磷酸酶。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Oct 5;101(40):14539-44. doi: 10.1073/pnas.0403174101. Epub 2004 Sep 23.
7
Inducing interactions with the CTD.诱导与CTD的相互作用。
Nat Struct Mol Biol. 2005 Feb;12(2):102-3. doi: 10.1038/nsmb0205-102.
8
NMR structure of a complex formed by the carboxyl-terminal domain of human RAP74 and a phosphorylated peptide from the central domain of the FCP1 phosphatase.人RAP74羧基末端结构域与FCP1磷酸酶中央结构域的磷酸化肽段形成的复合物的核磁共振结构
Biochemistry. 2009 Mar 10;48(9):1964-74. doi: 10.1021/bi801549m.
9
Role of C-terminal domain phosphorylation in RNA polymerase II transcription through the nucleosome.C末端结构域磷酸化在RNA聚合酶II通过核小体进行转录过程中的作用。
Biopolymers. 2003 Apr;68(4):528-38. doi: 10.1002/bip.10302.
10
Interactions of the HIV-1 Tat and RAP74 proteins with the RNA polymerase II CTD phosphatase FCP1.HIV-1反式激活因子(Tat)和RAP74蛋白与RNA聚合酶II羧基末端结构域磷酸酶FCP1的相互作用
Biochemistry. 2005 Mar 1;44(8):2716-31. doi: 10.1021/bi047957p.

引用本文的文献

1
The Ser7 phosphorylation of RNA polymerase II-CTD is required for the recruitment of E3 ubiquitin ligase Asr1 and subtelomeric gene silencing.RNA聚合酶II-CTD的Ser7磷酸化是招募E3泛素连接酶Asr1和端粒亚端粒基因沉默所必需的。
J Biol Chem. 2025 Jun 11;301(7):110365. doi: 10.1016/j.jbc.2025.110365.
2
Phosphorylation modulates secondary structure of intrinsically disorder regions in RNA polymerase II.磷酸化调节RNA聚合酶II中内在无序区域的二级结构。
J Biol Chem. 2025 Apr 22;301(6):108533. doi: 10.1016/j.jbc.2025.108533.
3
SSUP-72/PINN-1 coordinates RNA-polymerase II 3' pausing and developmental gene expression in C. elegans.
SSUP-72/PINN-1协调秀丽隐杆线虫中RNA聚合酶II的3'端暂停和发育基因表达。
Nat Commun. 2025 Mar 17;16(1):2624. doi: 10.1038/s41467-025-57847-x.
4
Sequence and structural determinants of RNAPII CTD phase-separation and phosphorylation by CDK7.RNAPII CTD 通过 CDK7 相分离和磷酸化的序列和结构决定因素。
Nat Commun. 2024 Oct 24;15(1):9163. doi: 10.1038/s41467-024-53305-2.
5
Clustering of RNA Polymerase II C-Terminal Domain Models upon Phosphorylation.RNA 聚合酶 II C 端结构域磷酸化后的聚集模型。
J Phys Chem B. 2024 Oct 24;128(42):10385-10396. doi: 10.1021/acs.jpcb.4c04457. Epub 2024 Oct 12.
6
Multiphosphorylation-Dependent Recognition of Anti-pS2 Antibodies against RNA Polymerase II C-Terminal Domain Revealed by Chemical Synthesis.通过化学合成揭示多磷酸化依赖性识别 RNA 聚合酶 II C 末端结构域的抗 pS2 抗体。
J Am Chem Soc. 2024 May 1;146(17):12074-12086. doi: 10.1021/jacs.4c01902. Epub 2024 Apr 19.
7
Impact of Protein Phosphatase Expressions on the Prognosis of Hepatocellular Carcinoma Patients.蛋白磷酸酶表达对肝细胞癌患者预后的影响
ACS Omega. 2024 Feb 20;9(9):10299-10331. doi: 10.1021/acsomega.3c07787. eCollection 2024 Mar 5.
8
Driving forces behind phase separation of the carboxy-terminal domain of RNA polymerase II.RNA 聚合酶 II 羧基末端结构域相分离的驱动力。
Nat Commun. 2023 Sep 25;14(1):5979. doi: 10.1038/s41467-023-41633-8.
9
Cyclin-dependent kinases: Masters of the eukaryotic universe.细胞周期蛋白依赖性激酶:真核生物世界的主宰。
Wiley Interdiscip Rev RNA. 2023 Sep 17;15(1):e1816. doi: 10.1002/wrna.1816.
10
Cyclins and cyclin-dependent kinases: from biology to tumorigenesis and therapeutic opportunities.细胞周期蛋白与细胞周期蛋白依赖性激酶:从生物学特性到肿瘤发生及治疗机遇
J Cancer Res Clin Oncol. 2023 Apr;149(4):1585-1606. doi: 10.1007/s00432-022-04135-6. Epub 2022 Jul 4.