• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

基于使用微流控配方仪确定的沉淀图来结晶蛋白质。

Crystallizing proteins on the basis of their precipitation diagram determined using a microfluidic formulator.

作者信息

Sommer Morten O A, Larsen Sine

机构信息

Centre for Crystallographic Studies, Department of Chemistry, University of Copenhagen, Denmark.

出版信息

J Synchrotron Radiat. 2005 Nov;12(Pt 6):779-85. doi: 10.1107/S0909049505002621. Epub 2005 Oct 18.

DOI:10.1107/S0909049505002621
PMID:16239748
Abstract

Crystallization of proteins from a purified protein solution remains a bottleneck in the structure determination pipeline. In this paper the crystallization problem is addressed using a microfluidic device capable of determining detailed protein precipitation diagrams using less than 10 microL of protein sample. Based on the experimentally determined protein phase behavior, a crystallization screen can be designed to accommodate the physical chemistry of the particular protein target. Such a tailor-made crystallization screen has a high probability of yielding crystallization hits. The approach is applied to two different proteins: the calcium pump (SERCA), an eukaryotic integral membrane protein, and UMP kinase, a prokaryotic soluble kinase. Protein phase behavior is mapped for both proteins and tailor-made crystallization screens are designed for the two proteins resulting in about 50% crystallization probability per experiment. This illustrates the power of using microfluidic devices for detailed characterization of protein phase behavior prior to crystallization trials.

摘要

从纯化的蛋白质溶液中结晶蛋白质仍然是结构测定流程中的一个瓶颈。在本文中,使用一种微流控装置来解决结晶问题,该装置能够用少于10微升的蛋白质样品确定详细的蛋白质沉淀图。基于实验确定的蛋白质相行为,可以设计一个结晶筛选方案来适应特定蛋白质靶点的物理化学性质。这样一个量身定制的结晶筛选方案有很高的概率产生结晶成功的结果。该方法应用于两种不同的蛋白质:钙泵(SERCA),一种真核整合膜蛋白,以及UMP激酶,一种原核可溶性激酶。绘制了这两种蛋白质的相行为图,并为这两种蛋白质设计了量身定制的结晶筛选方案,每次实验的结晶概率约为50%。这说明了在进行结晶试验之前,使用微流控装置详细表征蛋白质相行为的作用。

相似文献

1
Crystallizing proteins on the basis of their precipitation diagram determined using a microfluidic formulator.基于使用微流控配方仪确定的沉淀图来结晶蛋白质。
J Synchrotron Radiat. 2005 Nov;12(Pt 6):779-85. doi: 10.1107/S0909049505002621. Epub 2005 Oct 18.
2
Screening of protein crystallization conditions on a microfluidic chip using nanoliter-size droplets.使用纳升尺寸液滴在微流控芯片上筛选蛋白质结晶条件。
J Am Chem Soc. 2003 Sep 17;125(37):11170-1. doi: 10.1021/ja037166v.
3
Systematic investigation of protein phase behavior with a microfluidic formulator.使用微流体制剂对蛋白质相行为进行系统研究。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Oct 5;101(40):14431-6. doi: 10.1073/pnas.0405847101. Epub 2004 Sep 27.
4
An attempt to increase the efficiency of protein crystal screening: a simplified screen and experiments.提高蛋白质晶体筛选效率的尝试:一种简化的筛选方法及实验
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2005 Jun;61(Pt 6):776-9. doi: 10.1107/S0907444905014708. Epub 2005 May 26.
5
Protein crystallization: from purified protein to diffraction-quality crystal.蛋白质结晶:从纯化蛋白质到具有衍射质量的晶体
Nat Methods. 2008 Feb;5(2):147-53. doi: 10.1038/nmeth.f.203.
6
A microfluidic device for kinetic optimization of protein crystallization and in situ structure determination.一种用于蛋白质结晶动力学优化和原位结构测定的微流控装置。
J Am Chem Soc. 2006 Mar 15;128(10):3142-3. doi: 10.1021/ja0576637.
7
Phase knowledge enables rational screens for protein crystallization.相知识有助于对蛋白质结晶进行合理筛选。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 Nov 7;103(45):16746-51. doi: 10.1073/pnas.0605293103. Epub 2006 Oct 30.
8
A microfluidic device based on droplet storage for screening solubility diagrams.一种基于液滴存储的用于筛选溶解度图的微流控装置。
Lab Chip. 2007 Jul;7(7):829-34. doi: 10.1039/b700799j. Epub 2007 Apr 20.
9
A crystallization screen based on alternative polymeric precipitants.基于替代聚合物沉淀剂的结晶筛选。
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2010 Jun;66(Pt 6):685-97. doi: 10.1107/S0907444910009005. Epub 2010 May 15.
10
Attempts to rationalize protein crystallization using relative crystallizability.利用相对结晶能力使蛋白质结晶合理化的尝试。
J Struct Biol. 2006 Jun;154(3):297-302. doi: 10.1016/j.jsb.2006.02.010. Epub 2006 Mar 23.

引用本文的文献

1
An X-ray transparent microfluidic platform for screening of the phase behavior of lipidic mesophases.一种用于筛选类脂各向同性相行为的 X 射线透明微流控平台。
Analyst. 2013 Sep 21;138(18):5384-95. doi: 10.1039/c3an01174g. Epub 2013 Jul 24.
2
Microfluidic Generation of Lipidic Mesophases for Membrane Protein Crystallization.用于膜蛋白结晶的脂质中间相的微流体制备
Cryst Growth Des. 2009 Jun 3;9(6):2566-2569. doi: 10.1021/cg900289d.
3
Phase knowledge enables rational screens for protein crystallization.相知识有助于对蛋白质结晶进行合理筛选。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 Nov 7;103(45):16746-51. doi: 10.1073/pnas.0605293103. Epub 2006 Oct 30.