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msHOT:修改哈德逊的微卫星模拟器以纳入交叉和基因转换热点。

msHOT: modifying Hudson's ms simulator to incorporate crossover and gene conversion hotspots.

作者信息

Hellenthal Garrett, Stephens Matthew

机构信息

Department of Statistics, University of Oxford, 1 South Parks Road, Oxford OX1 3TG, UK.

出版信息

Bioinformatics. 2007 Feb 15;23(4):520-1. doi: 10.1093/bioinformatics/btl622. Epub 2006 Dec 6.

DOI:10.1093/bioinformatics/btl622
PMID:17150995
Abstract

UNLABELLED

We have incorporated both crossover and gene conversion hotspots into an existing coalescent-based program for simulating genetic variation data for a sample of chromosomes from a population.

AVAILABILITY

The source code for msHOT is available at http://home.uchicago.edu/~rhudson1, along with accompanying instructions.

摘要

未标注

我们已将交叉和基因转换热点纳入一个现有的基于合并的程序中,用于模拟来自一个群体的染色体样本的遗传变异数据。

可用性

msHOT的源代码可在http://home.uchicago.edu/~rhudson1获取,同时还有相关说明。

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