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重构稀疏连接动态网络的拓扑结构。

Reconstructing the topology of sparsely connected dynamical networks.

作者信息

Napoletani Domenico, Sauer Timothy D

机构信息

Department of Mathematical Sciences, George Mason University, Fairfax, Virginia 22030, USA.

出版信息

Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys. 2008 Feb;77(2 Pt 2):026103. doi: 10.1103/PhysRevE.77.026103. Epub 2008 Feb 8.

DOI:10.1103/PhysRevE.77.026103
PMID:18352086
Abstract

Given a general physical network and measurements of node dynamics, methods are proposed for reconstructing the network topology. We focus on networks whose connections are sparse and where data are limited. Under these conditions, common in many biological networks, constrained optimization techniques based on the L1 vector norm are found to be superior for inference of the network connections.

摘要

给定一个一般的物理网络和节点动态测量数据,本文提出了重建网络拓扑结构的方法。我们关注的是连接稀疏且数据有限的网络。在许多生物网络中常见的这些条件下,发现基于L1向量范数的约束优化技术在推断网络连接方面更具优势。

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