• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一种基于扩展人工调控网络的细胞模式生成模型。

A cell pattern generation model based on an extended artificial regulatory network.

作者信息

Chavoya Arturo, Duthen Yves

机构信息

Universidad de Guadalajara, Zapopan, Jal, Mexico.

出版信息

Biosystems. 2008 Oct-Nov;94(1-2):95-101. doi: 10.1016/j.biosystems.2008.05.015. Epub 2008 Jun 20.

DOI:10.1016/j.biosystems.2008.05.015
PMID:18616980
Abstract

Cell pattern generation has a fundamental role in both artificial and natural development. This paper presents results from a model in which a genetic algorithm (GA) was used to evolve an artificial regulatory network (ARN) to produce predefined 2D cell patterns through the selective activation and inhibition of genes. The ARN used in this work is an extension of a model previously used to create simple geometrical patterns. The GA worked by evolving the gene regulatory network that was used to control cell reproduction, which took place in a testbed based on cellular automata (CA). After the final chromosomes were produced, a single cell in the middle of the CA lattice was allowed to replicate controlled by the ARN found by the GA, until the desired cell pattern was formed. The model was applied to the problem of generating a French flag pattern.

摘要

细胞模式生成在人工和自然发育中都起着基础性作用。本文展示了一个模型的结果,在该模型中,遗传算法(GA)被用于进化人工调控网络(ARN),以通过基因的选择性激活和抑制来产生预定义的二维细胞模式。本研究中使用的ARN是先前用于创建简单几何图案的模型的扩展。GA通过进化用于控制细胞繁殖的基因调控网络来工作,细胞繁殖发生在基于细胞自动机(CA)的测试平台中。在产生最终的染色体后,CA晶格中间的单个细胞在GA找到的ARN控制下进行复制,直到形成所需的细胞模式。该模型被应用于生成法国国旗图案的问题。

相似文献

1
A cell pattern generation model based on an extended artificial regulatory network.一种基于扩展人工调控网络的细胞模式生成模型。
Biosystems. 2008 Oct-Nov;94(1-2):95-101. doi: 10.1016/j.biosystems.2008.05.015. Epub 2008 Jun 20.
2
Use of evolved artificial regulatory networks to simulate 3D cell differentiation.利用进化的人工调控网络模拟3D细胞分化。
Biosystems. 2010 Oct;102(1):41-8. doi: 10.1016/j.biosystems.2010.07.011. Epub 2010 Jul 22.
3
Genetic algorithms and their application to in silico evolution of genetic regulatory networks.遗传算法及其在基因调控网络的计算机模拟进化中的应用。
Methods Mol Biol. 2010;673:297-321. doi: 10.1007/978-1-60761-842-3_19.
4
Network topology and the evolution of dynamics in an artificial genetic regulatory network model created by whole genome duplication and divergence.全基因组复制和分化产生的人工遗传调控网络模型中的网络拓扑与动力学演化
Biosystems. 2006 Sep;85(3):177-200. doi: 10.1016/j.biosystems.2006.01.004. Epub 2006 May 2.
5
Structure of regulatory networks and diversity of gene expression patterns.调控网络的结构与基因表达模式的多样性。
J Theor Biol. 2008 Jan 21;250(2):307-21. doi: 10.1016/j.jtbi.2007.09.019. Epub 2007 Sep 21.
6
Prediction of pairwise gene interaction using threshold logic.使用阈值逻辑预测成对基因相互作用。
Ann N Y Acad Sci. 2009 Mar;1158:276-86. doi: 10.1111/j.1749-6632.2008.03763.x.
7
Inference of active transcriptional networks by integration of gene expression kinetics modeling and multisource data.通过整合基因表达动力学建模和多源数据推断活跃转录网络。
Genomics. 2009 May;93(5):426-33. doi: 10.1016/j.ygeno.2009.01.006. Epub 2009 Feb 5.
8
Fast calculation of pairwise mutual information for gene regulatory network reconstruction.用于基因调控网络重建的成对互信息的快速计算。
Comput Methods Programs Biomed. 2009 May;94(2):177-80. doi: 10.1016/j.cmpb.2008.11.003. Epub 2009 Jan 22.
9
Combining multiple results of a reverse-engineering algorithm: application to the DREAM five-gene network challenge.整合逆向工程算法的多个结果:应用于DREAM五基因网络挑战赛
Ann N Y Acad Sci. 2009 Mar;1158:102-13. doi: 10.1111/j.1749-6632.2008.03945.x.
10
Do motifs reflect evolved function?--No convergent evolution of genetic regulatory network subgraph topologies.基序是否反映了进化的功能?——基因调控网络子图拓扑结构不存在趋同进化。
Biosystems. 2008 Oct-Nov;94(1-2):68-74. doi: 10.1016/j.biosystems.2008.05.012. Epub 2008 Jun 20.