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AUGIST:在考虑基因树不确定性的情况下推断物种树。

AUGIST: inferring species trees while accommodating gene tree uncertainty.

作者信息

Oliver Jeffrey C

机构信息

Interdisciplinary Program in Insect Science, University of Arizona, Tucson, AZ 85721, USA.

出版信息

Bioinformatics. 2008 Dec 15;24(24):2932-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btn556. Epub 2008 Oct 25.

Abstract

SUMMARY

AUGIST (accomodating uncertainty in genealogies while inferring species tress) is a new software package for inferring species trees while accommodating uncertainty in gene genealogies. It is written for the Mesquite software system and provides sampling procedures to incorporate uncertainty in gene tree reconstruction while providing confidence estimates for inferred species trees.

AVAILABILITY

http://www.lycaenid.org/augist/

摘要

摘要

AUGIST(在推断物种树时考虑基因谱系中的不确定性)是一个新的软件包,用于在考虑基因谱系不确定性的同时推断物种树。它是为Mesquite软件系统编写的,提供了抽样程序,以便在基因树重建中纳入不确定性,同时为推断出的物种树提供置信度估计。

可用性

http://www.lycaenid.org/augist/

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/2a72/2639298/7165f9f7a87a/btn556f1.jpg

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