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二十面体病毒衣壳振动的群论:一种自上而下的方法。

Group theory of icosahedral virus capsid vibrations: a top-down approach.

作者信息

Peeters Kasper, Taormina Anne

机构信息

Institute for Theoretical Physics, Utrecht University, P.O. Box 80.195, 3508 TD Utrecht, The Netherlands.

出版信息

J Theor Biol. 2009 Feb 21;256(4):607-24. doi: 10.1016/j.jtbi.2008.10.019. Epub 2008 Oct 29.

Abstract

We explore the use of a top-down approach to analyse the dynamics of icosahedral virus capsids and complement the information obtained from bottom-up studies of viral vibrations available in the literature. A normal mode analysis based on protein association energies is used to study the frequency spectrum, in which we reveal a universal plateau of low-frequency modes shared by a large class of Caspar-Klug capsids. These modes break icosahedral symmetry and are potentially relevant to the genome release mechanism. We comment on the role of viral tiling theory in such dynamical considerations.

摘要

我们探索采用自上而下的方法来分析二十面体病毒衣壳的动力学,并补充从文献中关于病毒振动的自下而上研究中获得的信息。基于蛋白质缔合能的正常模式分析用于研究频谱,在该频谱中我们揭示了一大类卡斯帕 - 克卢格衣壳所共有的低频模式的通用平台。这些模式打破了二十面体对称性,并且可能与基因组释放机制相关。我们评论了病毒平铺理论在这种动力学考虑中的作用。

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