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植物基因库（PlantGM）：一个关于水稻（Oryza sativa）和大白菜（Brassica rapa）遗传标记的数据库。

PlantGM: a database for genetic markers in rice (Oryza sativa) and Chinese cabbage (Brassica rapa).

作者信息

Kim Chang Kug, Kim Jung Sun, Lee Gang Seob, Park Beom Seok, Hahn Jang Ho

机构信息

Bioinformatics Division, National Institute of Agricultural Biotechnology (NIAB), Suwon 441-707, Korea.

出版信息

Bioinformation. 2008;3(2):61-2. doi: 10.6026/97320630003061. Epub 2008 Oct 17.

DOI:10.6026/97320630003061
PMID:19238232
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2637951/
Abstract

UNLABELLED

The Plant Genetic Map Database (PlantGM) has been developed as a web-based system which provides information about genetic markers in rice (Oryza sativa) and Chinese cabbage (Brassica rapa). The database has three major parts and functions; (1) Map Search, (2) Marker Search, and (3) QTL Search. At present, the database provides characterization information for about 3258 genetic markers. It has 2800 RFLP and 112 QTL markers related to rice in addition to 321 RFLP and 25 PCR-based markers for Chinese cabbage. In addition, a genetic linkage map was also constructed by using 1,054 markers from 2,912 markers in rice.

AVAILABILITY

The database is available for free at http://www.niab.go.kr/nabic/PlantGM.

摘要

未标注

植物遗传图谱数据库（PlantGM）已开发为一个基于网络的系统，可提供水稻（Oryza sativa）和大白菜（Brassica rapa）遗传标记的信息。该数据库有三个主要部分和功能：（1）图谱搜索，（2）标记搜索，以及（3）QTL搜索。目前，该数据库提供约3258个遗传标记的特征信息。除了321个大白菜的RFLP标记和25个基于PCR的标记外，它还有2800个与水稻相关的RFLP标记和112个QTL标记。此外，还利用水稻2912个标记中的1054个标记构建了遗传连锁图谱。

可用性

该数据库可在http://www.niab.go.kr/nabic/PlantGM免费获取。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/75f2/2637951/423c3a251506/97320630003061F1.jpg
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