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MATICCE:连续字符演化中的转变映射。

MATICCE: mapping transitions in continuous character evolution.

机构信息

Herbarium, The Morton Arboretum, 4100 Illinois Route 53, Lisle, IL 60532-1293, USA.

出版信息

Bioinformatics. 2010 Jan 1;26(1):132-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btp625. Epub 2009 Oct 30.

DOI:10.1093/bioinformatics/btp625
PMID:19880368
Abstract

SUMMARY

MATICCE is a new software package in the R language for mapping phylogenetic transitions in organismal traits that have continuous distributions. MATICCE integrates over phylogenetic and model uncertainty and provides simulation functions for visualizing evolutionary scenarios based on estimated parameter values.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

MATICCE is written in the open source R language and freely available through the Comprehensive R Archive Network (http://cran.r-project.org/web/packages/maticce).

摘要

摘要

MATICCE 是 R 语言中的一个新软件包,用于对具有连续分布的生物体特征的系统发育转变进行映射。MATICCE 对系统发育和模型不确定性进行了整合,并提供了模拟功能,可根据估计的参数值可视化进化场景。

可用性和实现

MATICCE 是用开源的 R 语言编写的,并可通过 Comprehensive R Archive Network(http://cran.r-project.org/web/packages/maticce)免费获得。

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