• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

天然化学连接法合成及人 CCL2 晶体结构

Synthesis by native chemical ligation and crystal structure of human CCL2.

机构信息

Centocor Research and Development, Inc., Radnor, PA 19087, USA.

出版信息

Biopolymers. 2010;94(3):350-9. doi: 10.1002/bip.21390.

DOI:10.1002/bip.21390
PMID:20091676
Abstract

The protein human CC chemokine ligand 2 (CCL2, also known as monocyte chemoattractant protein 1 or MCP-1) has been synthesized using a combination of solid phase peptide synthesis (SPPS) and native chemical ligation (NCL). The thioester-peptide segment was synthesized using the sulfonamide safety-catch linker and 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) SPPS, and pseudoproline dipeptides were used to facilitate the synthesis of both CCL2 fragments. After assembly of the full-length peptide chain by NCL, a glutathione redox buffer was used to fold and oxidize the CCL2 protein. Synthetic human CCL2 binds to and activates the CCR2 receptor on THP-1 cells, as expected. CCL2 was crystallized and the structure was determined by X-ray diffraction at 1.9-A resolution. The structure of the synthetic protein is very similar to that of a previously reported structure of recombinant human CCL2, although the crystal form is different. The functional CCL2 dimer for the crystal structure reported here is formed around a crystallographic twofold axis. The dimer interface involves residues Val9-Thr10-Cys11, which form an intersubunit antiparallel beta-sheet. Comparison of the CCL2 dimers in different crystal forms indicates a significant flexibility of the quaternary structure. To our knowledge, this is one of the first crystal structures of a protein prepared using the sulfonamide safety-catch linker and NCL.

摘要

人蛋白 CC 趋化因子配体 2(CCL2,也称为单核细胞趋化蛋白 1 或 MCP-1)已使用固相肽合成(SPPS)和天然化学连接(NCL)的组合进行合成。硫酯肽段使用磺酰胺安全捕获接头和 9-芴甲氧羰基(Fmoc)SPPS 合成,并且使用拟肽二肽来促进 CCL2 片段的合成。通过 NCL 组装全长肽链后,使用谷胱甘肽氧化还原缓冲液折叠和氧化 CCL2 蛋白。合成的人 CCL2 与 THP-1 细胞上的 CCR2 受体结合并激活该受体,正如预期的那样。CCL2 被结晶,并且结构通过 X 射线衍射在 1.9-A 分辨率下确定。该合成蛋白的结构与先前报道的重组人 CCL2 的结构非常相似,尽管晶体形式不同。报告的晶体结构的功能性 CCL2 二聚体是围绕晶体学二倍轴形成的。二聚体界面涉及残基 Val9-Thr10-Cys11,其形成亚基间的反平行 β-折叠。不同晶体形式的 CCL2 二聚体的比较表明四级结构具有很大的灵活性。据我们所知,这是使用磺酰胺安全捕获接头和 NCL 制备的蛋白质的第一个晶体结构之一。

相似文献

1
Synthesis by native chemical ligation and crystal structure of human CCL2.天然化学连接法合成及人 CCL2 晶体结构
Biopolymers. 2010;94(3):350-9. doi: 10.1002/bip.21390.
2
Synthesis and biological characterization of human monocyte chemoattractant protein 1 (MCP-1) and its analogs.人单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)及其类似物的合成与生物学特性研究
J Pept Sci. 2006 Jan;12(1):25-32. doi: 10.1002/psc.680.
3
Identification of CCR2-binding features in Cytl1 by a CCL2-like chemokine model.通过类似于 CCL2 的趋化因子模型鉴定 Cytl1 中的 CCR2 结合特征。
Proteins. 2011 Apr;79(4):1277-92. doi: 10.1002/prot.22963. Epub 2011 Feb 14.
4
Structural basis for high selectivity of anti-CCL2 neutralizing antibody CNTO 888.抗 CCL2 中和抗体 CNTO 888 高选择性的结构基础。
Mol Immunol. 2012 Jun;51(2):227-33. doi: 10.1016/j.molimm.2012.03.022. Epub 2012 Apr 7.
5
Crystal structures of a poplar thioredoxin peroxidase that exhibits the structure of glutathione peroxidases: insights into redox-driven conformational changes.一种具有谷胱甘肽过氧化物酶结构的杨树硫氧还蛋白过氧化物酶的晶体结构:对氧化还原驱动的构象变化的见解。
J Mol Biol. 2007 Jul 13;370(3):512-29. doi: 10.1016/j.jmb.2007.04.031. Epub 2007 Apr 19.
6
Crystal structure of the peptidoglycan recognition protein at 1.8 A resolution reveals dual strategy to combat infection through two independent functional homodimers.肽聚糖识别蛋白1.8埃分辨率的晶体结构揭示了通过两个独立的功能性同型二聚体对抗感染的双重策略。
J Mol Biol. 2008 May 9;378(4):923-32. doi: 10.1016/j.jmb.2008.03.018. Epub 2008 Mar 19.
7
Crystal structure of tobacco necrosis virus at 2.25 A resolution.烟草坏死病毒2.25埃分辨率的晶体结构。
J Mol Biol. 2000 Jun 30;300(1):153-69. doi: 10.1006/jmbi.2000.3831.
8
Crystal structure of the extracellular domain of a bacterial ligand-gated ion channel.细菌配体门控离子通道胞外域的晶体结构。
J Mol Biol. 2010 Feb 5;395(5):1114-27. doi: 10.1016/j.jmb.2009.11.024. Epub 2009 Nov 13.
9
Structures of dimeric nonstandard nucleotide triphosphate pyrophosphatase from Pyrococcus horikoshii OT3: functional significance of interprotomer conformational changes.嗜热栖热菌OT3二聚体非标准核苷酸三磷酸焦磷酸酶的结构:原体间构象变化的功能意义
J Mol Biol. 2008 Jan 25;375(4):1013-25. doi: 10.1016/j.jmb.2007.11.018. Epub 2007 Nov 13.
10
Domain swapping in N-truncated human cystatin C.N端截短的人胱抑素C中的结构域交换
J Mol Biol. 2004 Jul 30;341(1):151-60. doi: 10.1016/j.jmb.2004.06.013.

引用本文的文献

1
Advances in the chemical synthesis of human proteoforms.人类蛋白质异构体化学合成的进展。
Sci China Life Sci. 2025 Apr 8. doi: 10.1007/s11427-024-2860-5.
2
Fundamental Aspects of SPPS and Green Chemical Peptide Synthesis.固相肽合成及绿色化学肽合成的基本方面。
J Pept Sci. 2025 May;31(5):e70013. doi: 10.1002/psc.70013.
3
Generating a mirror-image monobody targeting MCP-1 via TRAP display and chemical protein synthesis.通过TRAP展示和化学蛋白质合成生成靶向单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)的镜像单域抗体。
Nat Commun. 2024 Dec 23;15(1):10723. doi: 10.1038/s41467-024-54902-x.
4
Network Pharmacology Research Indicates that Wu-Mei-Wan Treats Obesity by Inhibiting Th17 Cell Differentiation and Alleviating Metabolic Inflammation.网络药理学研究表明,乌梅丸通过抑制 Th17 细胞分化和减轻代谢性炎症来治疗肥胖。
Comb Chem High Throughput Screen. 2023;26(1):30-48. doi: 10.2174/1386207325666220221121919.
5
Chemoenzymatic Semisynthesis of Proteins.酶促化学法半合成蛋白质。
Chem Rev. 2020 Mar 25;120(6):3051-3126. doi: 10.1021/acs.chemrev.9b00450. Epub 2019 Nov 27.
6
Molecular basis of lateral force spectroscopy nano-diagnostics: computational unbinding of autism related chemokine MCP-1 from IgG antibody.侧向力谱纳米诊断的分子基础:自闭症相关趋化因子 MCP-1 与 IgG 抗体的计算性解联。
J Mol Model. 2013 Nov;19(11):4773-80. doi: 10.1007/s00894-013-1972-z. Epub 2013 Sep 6.