• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

在基因组背景下对多个基因表达数据集进行可视化比较。

Visual comparison of multiple gene expression datasets in a genomic context.

作者信息

Borowski Krzysztof, Soh Jung, Sensen Christoph W

机构信息

Sun Center of Excellence for Visual Genomics, University of Calgary, Faculty of Medicine, 3330 Hospital Drive NW, Calgary, AB T2N 4N1, Canada.

出版信息

J Integr Bioinform. 2008 Aug 25;5(2):97. doi: 10.2390/biecoll-jib-2008-97.

DOI:10.2390/biecoll-jib-2008-97
PMID:20134066
Abstract

The need for novel methods of visualizing microarray data is growing. New perspectives are beneficial to finding patterns in expression data. The Bluejay genome browser provides an integrative way of visualizing gene expression datasets in a genomic context. We have now developed the functionality to display multiple microarray datasets simultaneously in Bluejay, in order to provide researchers with a comprehensive view of their datasets linked to a graphical representation of gene function. This will enable biologists to obtain valuable insights on expression patterns, by allowing them to analyze the expression values in relation to the gene locations as well as to compare expression profiles of related genomes or of different experiments for the same genome.

摘要

对可视化微阵列数据的新方法的需求正在不断增长。新的视角有助于在表达数据中发现模式。Bluejay基因组浏览器提供了一种在基因组背景下可视化基因表达数据集的综合方式。我们现在已经开发出在Bluejay中同时显示多个微阵列数据集的功能,以便为研究人员提供与其数据集相关的全面视图,该视图与基因功能的图形表示相关联。这将使生物学家能够通过允许他们分析与基因位置相关的表达值,以及比较相关基因组或同一基因组的不同实验的表达谱,从而获得关于表达模式的有价值的见解。

相似文献

1
Visual comparison of multiple gene expression datasets in a genomic context.在基因组背景下对多个基因表达数据集进行可视化比较。
J Integr Bioinform. 2008 Aug 25;5(2):97. doi: 10.2390/biecoll-jib-2008-97.
2
Cross-platform comparison and visualisation of gene expression data using co-inertia analysis.使用共惯性分析对基因表达数据进行跨平台比较和可视化
BMC Bioinformatics. 2003 Nov 21;4:59. doi: 10.1186/1471-2105-4-59.
3
Bluejay 1.0: genome browsing and comparison with rich customization provision and dynamic resource linking.蓝鸦1.0:具有丰富定制功能和动态资源链接的基因组浏览与比较。
BMC Bioinformatics. 2008 Oct 22;9:450. doi: 10.1186/1471-2105-9-450.
4
GeneShelf: a web-based visual interface for large gene expression time-series data repositories.GeneShelf:一个基于网络的可视化界面,用于大型基因表达时间序列数据库。
IEEE Trans Vis Comput Graph. 2009 Nov-Dec;15(6):905-12. doi: 10.1109/TVCG.2009.146.
5
SeeGH--a software tool for visualization of whole genome array comparative genomic hybridization data.SeeGH——一种用于可视化全基因组阵列比较基因组杂交数据的软件工具。
BMC Bioinformatics. 2004 Feb 9;5:13. doi: 10.1186/1471-2105-5-13.
6
The KLAB Toolbox: a suite of in-house software applications for epigenetic analysis.
Syst Biol Reprod Med. 2008 Mar-Apr;54(2):97-108. doi: 10.1080/19396360801935644.
7
Where are we in genomics?我们在基因组学领域处于什么位置?
J Physiol Pharmacol. 2005 Jun;56 Suppl 3:37-70.
8
GOLD.db: genomics of lipid-associated disorders database.GOLD数据库:脂质相关疾病基因组学数据库。
BMC Genomics. 2004 Dec 10;5(1):93. doi: 10.1186/1471-2164-5-93.
9
The Bluejay genome browser.蓝松鸦基因组浏览器。
Curr Protoc Bioinformatics. 2012 Mar;Chapter 10:Unit10.9. doi: 10.1002/0471250953.bi1009s37.
10
Mapping the gene expression universe.绘制基因表达全景图。
Curr Opin Genet Dev. 2008 Dec;18(6):506-12. doi: 10.1016/j.gde.2008.08.003. Epub 2008 Sep 20.