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IBWS:IST 生物信息学 Web 服务。

IBWS: IST Bioinformatics Web Services.

机构信息

Department of Informatics, Systems and Telematics, University of Genoa, Via Opera Pia 13, I-16145, Genoa, Italy.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2010 Jul;38(Web Server issue):W712-8. doi: 10.1093/nar/gkq416. Epub 2010 May 19.

DOI:10.1093/nar/gkq416
PMID:20484374
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2896171/
Abstract

The Bioinformatics group at the National Cancer Research Institute (IST) of Genoa has been involved since many years in the development and maintenance of biomedical information systems. Among them, the Common Access to Biological Resources and Information network services offer access to more than 130,000 biological resources, like strains of micro-organisms and human and animal cell lines, included in 29 collections from some of the most known European Biological Resource Centers. An Sequence Retrieval System (SRS) implementation of the TP53 Mutation Database of the International Agency for Research on Cancer (Lyon) was made available in order to improve interoperability of this data with other molecular biology databases. 'SRS by WS (SWS)', a system for retrieving information on public SRS sites and for directly querying them, was also implemented. In order to make this information available through application programming interfaces, we implemented a suite of free web services (WS), called the 'IST Bioinformatics Web Services (IBWS)'. A support web site, including a description of the system, a list of available WS together with help pages, links to corresponding WSDLs and forms for testing services, is available at http://bioinformatics.istge.it/ibws/. WSDL definitions can also be retrieved directly at http://bioinformatics.istge.it:8080/axis/services.

摘要

意大利热那亚国家癌症研究所的生物信息学组多年来一直致力于开发和维护生物医学信息系统。其中,公共生物资源和信息网络服务提供了超过 130,000 种生物资源的访问权限,包括来自欧洲一些最著名的生物资源中心的 29 个收藏中的微生物菌株、人类和动物细胞系。为了提高与其他分子生物学数据库的互操作性,还实现了国际癌症研究机构(里昂)TP53 突变数据库的序列检索系统(SRS)。还实现了一个用于检索公共 SRS 站点信息并直接查询它们的系统,称为“SRS by WS(SWS)”。为了通过应用程序编程接口提供这些信息,我们实现了一套免费的 Web 服务(WS),称为“IST 生物信息学 Web 服务(IBWS)”。一个支持网站,包括系统描述、可用 WS 的列表以及帮助页面、到相应 WSDL 的链接和用于测试服务的表单,可在 http://bioinformatics.istge.it/ibws/ 获得。WSDL 定义也可以直接在 http://bioinformatics.istge.it:8080/axis/services 上检索。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/c866/2896171/6d2ea7235385/gkq416f2.jpg
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