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星际区域中氨基酸前体的自由基形成?丝氨酸、半胱氨酸和天冬氨酸。

Radical formation of amino acid precursors in interstellar regions? Ser, Cys and Asp.

机构信息

Department of Chemistry, The University of Adelaide, South Australia, 5005, Australia.

出版信息

Org Biomol Chem. 2010 Nov 7;8(21):4934-9. doi: 10.1039/c0ob00232a. Epub 2010 Aug 31.

Abstract

It is proposed that the glycine precursor NH(2)CH(2)CN may be synthesised in interstellar dust clouds by the radical combination reactions NH(2)˙ + ˙CH(2)CN → NH(2)CH(2)CN (ΔG = -302 kJ mol(-1)) and/or NH(2)CH(2)˙ + ˙CN → NH(2)CH(2)CN (ΔG = -414 kJ mol(-1)). All calculations at the CCSD(T)/aug-cc-pVDZ//B3LYP/6-31+G(d) level of theory. This paper extends that concept to radical/radical coupling reactions to form Ser, Cys and Asp precursor nitriles. The hydrogen abstraction process NH(2)CH(2)CN + HO˙→ NH(2)˙CHCN + H(2)O (ΔG = -130 kJ mol(-1)) is suggested to precede the radical coupling reactions NH(2)˙CHCN + R˙→ NH(2)CHRCN (R˙ = ˙CH(2)OH, ˙CH(2)SH and ˙CH(2)CN) to form nitrile precursors of the amino acids Ser, Cys and Asp. These three reactions are all favourable (ΔG = -240, -227 and -223 kJ mol(-1)). The radical species ˙CH(2)NH(2), ˙CH(2)OH, ˙CH(2)SH and ˙CH(2)CN are shown to be stable for the microsecond timeframe by a combination of theoretical calculations and the experimental mass spectrometric neutralization/reionization procedure.

摘要

有人提出,甘氨酸前体 NH(2)CH(2)CN 可能是通过星际尘埃云中的自由基组合反应 NH(2)˙ + ˙CH(2)CN → NH(2)CH(2)CN (ΔG = -302 kJ mol(-1)) 和/或 NH(2)CH(2)˙ + ˙CN → NH(2)CH(2)CN (ΔG = -414 kJ mol(-1)) 合成的。所有计算均在 CCSD(T)/aug-cc-pVDZ//B3LYP/6-31+G(d)理论水平上进行。本文将这一概念扩展到自由基/自由基偶联反应,以形成 Ser、Cys 和 Asp 前体腈。建议 NH(2)CH(2)CN + HO˙→ NH(2)˙CHCN + H(2)O (ΔG = -130 kJ mol(-1)) 的氢提取过程先于自由基偶联反应 NH(2)˙CHCN + R˙→ NH(2)CHRCN (R˙ = ˙CH(2)OH、˙CH(2)SH 和 ˙CH(2)CN) 发生,以形成 Ser、Cys 和 Asp 氨基酸的腈前体。这三个反应都是有利的 (ΔG = -240、-227 和 -223 kJ mol(-1))。通过理论计算和实验质谱中性化/再离子化程序的组合,证明自由基物种 ˙CH(2)NH(2)、˙CH(2)OH、˙CH(2)SH 和 ˙CH(2)CN 在微秒时间范围内是稳定的。

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