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TE 显示器,用于转座因子的后基因组分析。

TE Displayer for post-genomic analysis of transposable elements.

机构信息

Department of Cell and Systems Biology, University of Toronto, Toronto, Canada.

出版信息

Bioinformatics. 2011 Jan 15;27(2):286-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btq639. Epub 2010 Nov 11.

DOI:10.1093/bioinformatics/btq639
PMID:21075749
Abstract

SUMMARY

TE Displayer can be used to retrieve genetic polymorphisms caused by transposable elements (TEs) in large-genomic datasets and present the results on virtual gel images. This enables researchers to compare TE profiles in silico and provides reference profiles for experimental analyses.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

Freely available on the web at http://labs.csb.utoronto.ca/yang/TE_Displayer.

摘要

摘要

TE Displayer 可用于检索大型基因组数据集中由转座元件 (TE) 引起的遗传多态性,并在虚拟凝胶图像上显示结果。这使研究人员能够在计算机上比较 TE 图谱,并为实验分析提供参考图谱。

可用性和实现

可在 http://labs.csb.utoronto.ca/yang/TE_Displayer 上免费获得。

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