• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

MML工具包与工作流程概述:从CellML创建时空心脏模型。

MML toolkit and work flow overview: Creating temporo-spatial heart models from CellML.

作者信息

Chang David C, Dokos Socrates, Lovell Nigel H

机构信息

Graduate School of Biomedical Engineering, University of New South Wales, Sydney, 2052 Australia.

出版信息

Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2010;2010:1481-4. doi: 10.1109/IEMBS.2010.5626847.

DOI:10.1109/IEMBS.2010.5626847
PMID:21096362
Abstract

The Modeling Markup Language (MML) framework is a conceptual paradigm to quickly develop and solve biological models utilizing the CellML specification. In this study, we present the open source toolkit developed for this project and a possible workflow to create different scales of cardiac tissue models from a range of CellML models. Models from the CellML repository and other sources were tested for interoperability against the MML framework. Furthermore, to demonstrate the ability of the MML framework to deploy different scales of geometry, a model of atrial electrical activation is also presented.

摘要

建模标记语言(MML)框架是一种概念范式,用于利用CellML规范快速开发和求解生物模型。在本研究中,我们展示了为该项目开发的开源工具包以及从一系列CellML模型创建不同尺度心脏组织模型的可能工作流程。对来自CellML存储库和其他来源的模型进行了针对MML框架的互操作性测试。此外,为了证明MML框架部署不同尺度几何形状的能力,还展示了一个心房电激活模型。

相似文献

1
MML toolkit and work flow overview: Creating temporo-spatial heart models from CellML.MML工具包与工作流程概述:从CellML创建时空心脏模型。
Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2010;2010:1481-4. doi: 10.1109/IEMBS.2010.5626847.
2
Temporo-spatial model construction using the MML and software framework.使用 MML 和软件框架构建时空模型。
IEEE Trans Biomed Eng. 2011 Dec;58(12):3528-31. doi: 10.1109/TBME.2011.2168955. Epub 2011 Sep 23.
3
Design of a framework for modeling, integration and simulation of physiological models.生理模型建模、整合与仿真框架的设计
Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2010;2010:1485-9. doi: 10.1109/IEMBS.2010.5626848.
4
ART-ML - a novel XML format for the biological procedures modeling and the representation of blood flow simulation.ART-ML——一种用于生物过程建模和血流模拟表示的新型XML格式。
Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2010;2010:1490-3. doi: 10.1109/IEMBS.2010.5626846.
5
A platform for in silico modeling of physiological systems II. CellML compatibility and other extended capabilities.生理系统计算机模拟平台II. CellML兼容性及其他扩展功能。
Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2008;2008:573-6. doi: 10.1109/IEMBS.2008.4649217.
6
Modelling heart beat initiation and propagation using the MML framework.
Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2009;2009:4495-8. doi: 10.1109/IEMBS.2009.5333683.
7
nmsBuilder: Freeware to create subject-specific musculoskeletal models for OpenSim.nmsBuilder:用于为 OpenSim 创建特定于主题的肌肉骨骼模型的免费软件。
Comput Methods Programs Biomed. 2017 Dec;152:85-92. doi: 10.1016/j.cmpb.2017.09.012. Epub 2017 Sep 18.
8
CellML 2.0.CellML 2.0.
J Integr Bioinform. 2020 Jul 24;17(2-3):20200021. doi: 10.1515/jib-2020-0021.
9
Parameter identifiability of cardiac ionic models using a novel CellML least squares optimization tool.使用新型CellML最小二乘优化工具对心脏离子模型进行参数识别
Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2007;2007:5307-10. doi: 10.1109/IEMBS.2007.4353539.
10
GiPSi:a framework for open source/open architecture software development for organ-level surgical simulation.GiPSi:用于器官级手术模拟的开源/开放架构软件开发框架。
IEEE Trans Inf Technol Biomed. 2006 Apr;10(2):312-22. doi: 10.1109/titb.2006.864479.

引用本文的文献

1
Computational medicine: translating models to clinical care.计算医学:将模型转化为临床护理。
Sci Transl Med. 2012 Oct 31;4(158):158rv11. doi: 10.1126/scitranslmed.3003528.