• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

研究大分子复合物:方法工具包。

Investigating a macromolecular complex: the toolkit of methods.

机构信息

Department of Biochemistry, NKI, Plesmanlaan 121, 1066 CX, Amsterdam, The Netherlands.

出版信息

J Struct Biol. 2011 Aug;175(2):106-12. doi: 10.1016/j.jsb.2011.05.014. Epub 2011 May 18.

DOI:10.1016/j.jsb.2011.05.014
PMID:21620973
Abstract

Structural biologists studying macromolecular complexes spend considerable effort doing strictly "non-structural" work: investigating the physiological relevance and biochemical properties of a complex, preparing homogeneous samples for structural analysis, and experimentally validating structure-based hypotheses regarding function or mechanism. Familiarity with the diverse perspectives and techniques available for studying complexes helps in the critical assessment of non-structural data, expedites the pre-structural characterization of a complex and facilitates the investigation of function. Here we survey the approaches and techniques used to study macromolecular complexes from various viewpoints, including genetics, cell and molecular biology, biochemistry/biophysics, structural biology, and systems biology/bioinformatics. The aim of this overview is to heighten awareness of the diversity of perspectives and experimental tools available for investigating complexes and of their usefulness for the structural biologist.

摘要

结构生物学家在研究大分子复合物时,花费了大量精力进行严格的“非结构”工作:研究复合物的生理相关性和生化特性,为结构分析准备均质样品,并通过实验验证关于功能或机制的基于结构的假设。熟悉用于研究复合物的各种观点和技术有助于对非结构数据进行批判性评估,加速复合物的预结构表征,并促进功能研究。在这里,我们从多个角度调查了用于研究大分子复合物的方法和技术,包括遗传学、细胞和分子生物学、生物化学/生物物理学、结构生物学和系统生物学/生物信息学。本综述的目的是提高人们对研究复合物的各种观点和实验工具的认识,以及它们对结构生物学家的有用性。

相似文献

1
Investigating a macromolecular complex: the toolkit of methods.研究大分子复合物:方法工具包。
J Struct Biol. 2011 Aug;175(2):106-12. doi: 10.1016/j.jsb.2011.05.014. Epub 2011 May 18.
2
Three-dimensional modeling of protein interactions and complexes is going 'omics.蛋白质相互作用和复合物的三维建模正在进入“组学”时代。
Curr Opin Struct Biol. 2011 Apr;21(2):200-8. doi: 10.1016/j.sbi.2011.01.005. Epub 2011 Feb 12.
3
Structural characterization of assemblies from overall shape and subcomplex compositions.通过整体形状和亚复合物组成对装配体进行结构表征。
Structure. 2005 Mar;13(3):435-45. doi: 10.1016/j.str.2005.01.013.
4
Fast predictions of thermodynamics and kinetics of protein-protein recognition from structures: from molecular design to systems biology.从结构快速预测蛋白质-蛋白质识别的热力学和动力学:从分子设计到系统生物学
Mol Biosyst. 2009 Apr;5(4):323-34. doi: 10.1039/b821580d. Epub 2009 Feb 19.
5
Identifying components of complexes.识别复合物的组成成分。
Methods Mol Biol. 2008;453:257-65. doi: 10.1007/978-1-60327-429-6_13.
6
Identifying protein complexes using hybrid properties.利用混合特性鉴定蛋白质复合物。
J Proteome Res. 2009 Nov;8(11):5212-8. doi: 10.1021/pr900554a.
7
Protein complexes: structure prediction challenges for the 21st century.蛋白质复合体:21世纪的结构预测挑战
Curr Opin Struct Biol. 2005 Feb;15(1):15-22. doi: 10.1016/j.sbi.2005.01.012.
8
Usefulness and limitations of normal mode analysis in modeling dynamics of biomolecular complexes.正常模式分析在生物分子复合物动力学建模中的作用与局限性
Structure. 2005 Mar;13(3):373-80. doi: 10.1016/j.str.2005.02.002.
9
Specificity of molecular interactions in transient protein-protein interaction interfaces.瞬时蛋白质-蛋白质相互作用界面中分子相互作用的特异性
Proteins. 2006 Nov 15;65(3):593-606. doi: 10.1002/prot.21056.
10
Accounting for conformational changes during protein-protein docking.考虑蛋白质-蛋白质对接过程中的构象变化。
Curr Opin Struct Biol. 2010 Apr;20(2):180-6. doi: 10.1016/j.sbi.2010.02.001. Epub 2010 Mar 1.

引用本文的文献

1
Electroporated recombinant proteins as tools for in vivo functional complementation, imaging and chemical biology.电穿孔重组蛋白作为体内功能互补、成像和化学生物学的工具。
Elife. 2019 Jul 16;8:e48287. doi: 10.7554/eLife.48287.
2
Baculovirus expression: old dog, new tricks.杆状病毒表达:老方法,新应用。
Bioengineered. 2015;6(6):316-22. doi: 10.1080/21655979.2015.1104433.
3
The emerging role of native mass spectrometry in characterizing the structure and dynamics of macromolecular complexes.原生质谱在表征大分子复合物结构和动力学方面的新作用。
Protein Sci. 2015 Aug;24(8):1176-92. doi: 10.1002/pro.2661. Epub 2015 Mar 31.
4
Subunit organisation of in vitro reconstituted HOPS and CORVET multisubunit membrane tethering complexes.体外重建 HOPS 和 CORVET 多亚基膜连接复合物的亚基组织。
PLoS One. 2013 Dec 2;8(12):e81534. doi: 10.1371/journal.pone.0081534. eCollection 2013.
5
Towards a structural biology work bench.迈向结构生物学工作台。
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2013 May;69(Pt 5):681-2. doi: 10.1107/S090744491300276X. Epub 2013 Apr 19.
6
A protocol for the identification of protein-protein interactions based on 15N metabolic labeling, immunoprecipitation, quantitative mass spectrometry and affinity modulation.一种基于15N代谢标记、免疫沉淀、定量质谱分析和亲和力调节的蛋白质-蛋白质相互作用鉴定方案。
J Vis Exp. 2012 Sep 24(67):4083. doi: 10.3791/4083.