• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

利用 PCR 扩增 cpDNA 基因的限制性位点变异进行玄参族(玄参科)的系统发育分析。

Using restriction-site variation of PCR-amplified cpDNA genes for phylogenetic analysis of tribe Cheloneae (Scrophulariaceae).

出版信息

Am J Bot. 1997 Apr;84(4):555.

PMID:21708607
Abstract

Data from restriction-site variation of three PCR-amplified chloroplast genic regions (trnK, rps2, and rbcL) were used to assess the utility of PCR-based methodology for phylogenetic reconstruction. Seventeen genera from tribe Cheloneae s.l. (Scrophulariaceae), and one genus each from Solanaceae, Acanthaceae, and Bignoniaceae, representing 32 taxa, were sampled. Phylogenetic reconstruction, based on a combined data set of 138 variable restriction sites, revealed a monophyletic clade of North American Cheloneae, which were not inconsistent with a polyphyletic Scrophulariaceae. Separate analyses of individual genie regions were unable to completely resolve the phylogeny, but were adequate for resolving relationships of major clades among the taxa sampled. We suggest that analysis of PCR-product restriction-site variation is useful for phylogenetic reconstruction above the species level.

摘要

使用来自三个叶绿体基因区域(trnK、rps2 和 rbcL)的 PCR 扩增限制位点变化的数据来评估基于 PCR 的方法在系统发育重建中的效用。从玄参科 Cheloneae 族(玄参科)的 17 个属,茄科、爵床科和紫葳科的每个属各 1 个属,代表 32 个分类单元,进行了采样。基于 138 个可变限制位点的组合数据集的系统发育重建揭示了北美的 Cheloneae 是一个单系群,与多系的玄参科不一致。个别基因区域的单独分析无法完全解决系统发育问题,但足以解决所采样分类单元之间的主要分支关系。我们建议,分析 PCR 产物限制位点变化对于种以上水平的系统发育重建是有用的。

相似文献

1
Using restriction-site variation of PCR-amplified cpDNA genes for phylogenetic analysis of tribe Cheloneae (Scrophulariaceae).利用 PCR 扩增 cpDNA 基因的限制性位点变异进行玄参族(玄参科)的系统发育分析。
Am J Bot. 1997 Apr;84(4):555.
2
Towards a more robust molecular phylogeny of Chinese Apiaceae subfamily Apioideae: additional evidence from nrDNA ITS and cpDNA intron (rpl16 and rps16) sequences.构建更可靠的中国伞形科芹亚科分子系统发育树:来自nrDNA ITS和cpDNA内含子(rpl16和rps16)序列的更多证据
Mol Phylogenet Evol. 2009 Oct;53(1):56-68. doi: 10.1016/j.ympev.2009.05.029. Epub 2009 Jun 6.
3
Large multi-locus plastid phylogeny of the tribe Arundinarieae (Poaceae: Bambusoideae) reveals ten major lineages and low rate of molecular divergence.大的多基因座质体系统发育分析揭示了 Arundinarieae 族(禾本科:竹亚科)的十个主要谱系和低分子分化率。
Mol Phylogenet Evol. 2010 Aug;56(2):821-39. doi: 10.1016/j.ympev.2010.03.041. Epub 2010 Apr 8.
4
Disintegration of the scrophulariaceae.玄参科的解体。
Am J Bot. 2001 Feb;88(2):348-61.
5
Combined phylogenetic analysis in the Rubiaceae-Ixoroideae: morphology, nuclear and chloroplast DNA data.茜草科-Ixoroideae 的联合系统发育分析:形态学、核和叶绿体 DNA 数据。
Am J Bot. 2000 Nov;87(11):1731-48.
6
Phylogenetic relationships and evolution of Crassulaceae inferred from matK sequence data.基于matK序列数据推断景天科植物的系统发育关系与进化
Am J Bot. 2001 Jan;88(1):76-91.
7
Phylogenetic relationships in the Crassulaceae inferred from chloroplast DNA restriction-site variation.石蒜科叶绿体 DNA 限制位点变异推断的系统发育关系。
Am J Bot. 1998 Jan;85(1):123.
8
ITS sequence data support a single origin for North American Astereae (Asteraceae) and reflect deep geographic divisions in Aster s.l.ITS 序列数据支持北美 Asterae(菊科)的单一起源,并反映了 Aster s.l. 的深刻地理分区。
Am J Bot. 1999 Mar;86(3):398-412.
9
The utility of nuclear conserved ortholog set II (COSII) genomic regions for species-level phylogenetic inference in Lycium (Solanaceae).核保守直系同源物集 II(COSII)基因组区域在茄科枸杞属物种水平系统发育推断中的应用。
Mol Phylogenet Evol. 2009 Dec;53(3):881-90. doi: 10.1016/j.ympev.2009.08.016. Epub 2009 Aug 19.
10
Molecular phylogeny of Coelogyne (Epidendroideae; Orchidaceae) based on plastid RFLPS, matK, and nuclear ribosomal ITS sequences: evidence for polyphyly.基于质体 RFLP、matK 和核核糖体 ITS 序列的 Coelogyne(Epidendroideae;Orchidaceae)分子系统发育:多系性证据。
Am J Bot. 2001 Oct;88(10):1915-27.

引用本文的文献

1
Phylogenetic and evolutionary relationships between Elymus humidus and other Elymus species based on sequencing of non-coding regions of cpDNA and AFLP of nuclear DNA.基于叶绿体DNA非编码区测序和核DNA扩增片段长度多态性分析的湿生披碱草与其他披碱草属物种之间的系统发育和进化关系
Theor Appl Genet. 2004 May;108(8):1443-8. doi: 10.1007/s00122-004-1588-x. Epub 2004 Feb 12.