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MyBioNet:在网络上交互式可视化、编辑和合并生物网络。

MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the web.

机构信息

Department of Bioinformatics, State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry, College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China.

出版信息

Bioinformatics. 2011 Dec 1;27(23):3321-2. doi: 10.1093/bioinformatics/btr557. Epub 2011 Oct 7.

DOI:10.1093/bioinformatics/btr557
PMID:21984760
Abstract

SUMMARY

MyBioNet is a web-based application for biological network analysis, which provides user-friendly web interfaces to visualize, edit and merge biological networks. In addition, MyBioNet integrated KEGG metabolic network data from 1366 organisms and allows users to search and navigate interesting networks.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

All KEGG metabolic network data are organized and stored in the MySQL database. MyBioNet is implemented in Flex/Actionscript and PHP languages and deployed on an Apache web server. MyBioNet is accessible through all the Flash-embedded browsers at http://bis.zju.edu.cn/mybionet/.

CONTACT

mchen@zju.edu.cn.

摘要

摘要

MyBioNet 是一个基于网络的生物网络分析应用程序,它提供了用户友好的网络界面,用于可视化、编辑和合并生物网络。此外,MyBioNet 集成了来自 1366 个生物体的 KEGG 代谢网络数据,允许用户搜索和浏览有趣的网络。

可用性和实现

所有 KEGG 代谢网络数据都组织并存储在 MySQL 数据库中。MyBioNet 是用 Flex/Actionscript 和 PHP 语言实现的,并部署在 Apache 网络服务器上。MyBioNet 可以通过所有嵌入 Flash 的浏览器在 http://bis.zju.edu.cn/mybionet/ 访问。

联系方式

mchen@zju.edu.cn。

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