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Carving:神经体积电子显微镜图像的可扩展交互式分割

Carving: scalable interactive segmentation of neural volume electron microscopy images.

作者信息

Straehle C N, Köthe U, Knott G, Hamprecht F A

机构信息

University of Heidelberg, Heidelberg, Germany HCI, Speyerer Strasse 6, D-69115 Heidelberg.

出版信息

Med Image Comput Comput Assist Interv. 2011;14(Pt 1):653-60. doi: 10.1007/978-3-642-23623-5_82.

DOI:10.1007/978-3-642-23623-5_82
PMID:22003674
Abstract

Interactive segmentation algorithms should respond within seconds and require minimal user guidance. This is a challenge on 3D neural electron microscopy images. We propose a supervoxel-based energy function with a novel background prior that achieves these goals. This is verified by extensive experiments with a robot mimicking human interactions. A graphical user interface offering access to an open source implementation of these algorithms is made available.

摘要

交互式分割算法应在数秒内做出响应,且只需最少的用户指导。这对于三维神经电子显微镜图像来说是一项挑战。我们提出了一种基于超体素的能量函数,并带有一种新颖的背景先验知识,以此实现这些目标。通过一个模仿人类交互的机器人进行的大量实验验证了这一点。我们提供了一个图形用户界面,可用于访问这些算法的开源实现。

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