• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

全面研究天然 TALE DNA 结合模块和转录抑制结构域。

Comprehensive interrogation of natural TALE DNA-binding modules and transcriptional repressor domains.

机构信息

Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.

出版信息

Nat Commun. 2012 Jul 24;3:968. doi: 10.1038/ncomms1962.

DOI:10.1038/ncomms1962
PMID:22828628
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3556390/
Abstract

Transcription activator-like effectors are sequence-specific DNA-binding proteins that harbour modular, repetitive DNA-binding domains. Transcription activator-like effectors have enabled the creation of customizable designer transcriptional factors and sequence-specific nucleases for genome engineering. Here we report two improvements of the transcription activator-like effector toolbox for achieving efficient activation and repression of endogenous gene expression in mammalian cells. We show that the naturally occurring repeat-variable diresidue Asn-His (NH) has high biological activity and specificity for guanine, a highly prevalent base in mammalian genomes. We also report an effective transcription activator-like effector transcriptional repressor architecture for targeted inhibition of transcription in mammalian cells. These findings will improve the precision and effectiveness of genome engineering that can be achieved using transcription activator-like effectors.

摘要

转录激活子样效应物是序列特异性 DNA 结合蛋白,具有模块化、重复的 DNA 结合结构域。转录激活子样效应物使定制设计的转录因子和序列特异性核酸酶的创建成为可能,用于基因组工程。在这里,我们报告了转录激活子样效应物工具箱的两项改进,以实现哺乳动物细胞中内源基因表达的高效激活和抑制。我们表明,天然存在的重复可变二残基天冬酰胺-组氨酸 (NH) 具有针对鸟嘌呤的高生物活性和特异性,鸟嘌呤是哺乳动物基因组中非常常见的碱基。我们还报告了一种有效的转录激活子样效应物转录抑制剂结构,用于靶向抑制哺乳动物细胞中的转录。这些发现将提高使用转录激活子样效应物实现的基因组工程的精度和有效性。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8d5b/3556390/fdf432daedd3/nihms425610f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8d5b/3556390/8230d36cc27b/nihms425610f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8d5b/3556390/608aa48c6363/nihms425610f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8d5b/3556390/8e648fe56bf0/nihms425610f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8d5b/3556390/fdf432daedd3/nihms425610f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8d5b/3556390/8230d36cc27b/nihms425610f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8d5b/3556390/608aa48c6363/nihms425610f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8d5b/3556390/8e648fe56bf0/nihms425610f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8d5b/3556390/fdf432daedd3/nihms425610f4.jpg

相似文献

1
Comprehensive interrogation of natural TALE DNA-binding modules and transcriptional repressor domains.全面研究天然 TALE DNA 结合模块和转录抑制结构域。
Nat Commun. 2012 Jul 24;3:968. doi: 10.1038/ncomms1962.
2
Exploring the transcription activator-like effectors scaffold versatility to expand the toolbox of designer nucleases.探索转录激活样效应因子支架的多功能性以扩展定制核酸酶的工具库。
BMC Mol Biol. 2014 Jul 5;15:13. doi: 10.1186/1471-2199-15-13.
3
A multiplexed transcription activator-like effector system for detecting specific DNA sequences.一种用于检测特定DNA序列的多重转录激活因子样效应物系统。
ACS Synth Biol. 2014 Dec 19;3(12):953-5. doi: 10.1021/sb500045w.
4
A transcription activator-like effector toolbox for genome engineering.转录激活因子样效应物工具盒用于基因组工程。
Nat Protoc. 2012 Jan 5;7(1):171-92. doi: 10.1038/nprot.2011.431.
5
TAL effectors: customizable proteins for DNA targeting.TAL 效应因子:可定制的 DNA 靶向蛋白。
Science. 2011 Sep 30;333(6051):1843-6. doi: 10.1126/science.1204094.
6
TALE: a tale of genome editing.TALE:一段基因组编辑的故事。
Prog Biophys Mol Biol. 2014 Jan;114(1):25-32. doi: 10.1016/j.pbiomolbio.2013.11.006. Epub 2013 Nov 27.
7
Assembly of designer TAL effectors by Golden Gate cloning.通过 Golden Gate 克隆组装设计的 TAL 效应子。
PLoS One. 2011;6(5):e19722. doi: 10.1371/journal.pone.0019722. Epub 2011 May 19.
8
TALE nucleases: tailored genome engineering made easy.TALE 核酸酶:定制化基因组工程变得轻而易举。
Curr Opin Biotechnol. 2012 Oct;23(5):644-50. doi: 10.1016/j.copbio.2012.01.013. Epub 2012 Feb 17.
9
TAL Effector DNA-Binding Principles and Specificity.转录激活样效应因子(TAL)的效应物DNA结合原理及特异性。
Methods Mol Biol. 2016;1338:9-25. doi: 10.1007/978-1-4939-2932-0_2.
10
Chimerization Enables Gene Synthesis and Lentiviral Delivery of Customizable TALE-Based Effectors.嵌合化使得基于 TALE 的定制效应子的基因合成和慢病毒传递成为可能。
Int J Mol Sci. 2020 Jan 25;21(3):795. doi: 10.3390/ijms21030795.

引用本文的文献

1
Enhanced anti-tumor activity by zinc finger repressor-driven epigenetic silencing of immune checkpoints and TGFBR2 in CAR-T cells and TILs.通过锌指阻遏物驱动的免疫检查点和CAR-T细胞及肿瘤浸润淋巴细胞中TGFBR2的表观遗传沉默增强抗肿瘤活性。
Mol Ther Oncol. 2025 May 7;33(2):200989. doi: 10.1016/j.omton.2025.200989. eCollection 2025 Jun 18.
2
Precise genome editing process and its applications in plants driven by AI.由人工智能驱动的精确基因组编辑过程及其在植物中的应用。
Funct Integr Genomics. 2025 May 24;25(1):109. doi: 10.1007/s10142-025-01619-9.
3
Optimization of mtDNA-targeted platinum TALENs for bi-directionally modifying heteroplasmy levels in patient-derived m.3243A>G-iPSCs.

本文引用的文献

1
Free-energy simulations reveal that both hydrophobic and polar interactions are important for influenza hemagglutinin antibody binding.自由能模拟揭示,疏水性和极性相互作用对于流感血凝素抗体结合都很重要。
Biophys J. 2012 Mar 21;102(6):1453-61. doi: 10.1016/j.bpj.2012.01.043. Epub 2012 Mar 20.
2
The crystal structure of TAL effector PthXo1 bound to its DNA target.TAL 效应因子 PthXo1 与其 DNA 靶标结合的晶体结构。
Science. 2012 Feb 10;335(6069):716-9. doi: 10.1126/science.1216211. Epub 2012 Jan 5.
3
A transcription activator-like effector toolbox for genome engineering.
用于双向修饰患者来源的m.3243A>G诱导多能干细胞中异质性水平的线粒体DNA靶向铂类转录激活样效应因子核酸酶的优化
Mol Ther Nucleic Acids. 2025 Mar 19;36(2):102521. doi: 10.1016/j.omtn.2025.102521. eCollection 2025 Jun 10.
4
A simple and efficient TALEN system for genome editing in plants.一种用于植物基因组编辑的简单高效的转录激活样效应因子核酸酶(TALEN)系统。
Plant Mol Biol. 2025 Jan 21;115(1):25. doi: 10.1007/s11103-025-01551-3.
5
Diversity and structural-functional insights of alpha-solenoid proteins.α-螺旋蛋白的多样性和结构功能见解。
Protein Sci. 2024 Nov;33(11):e5189. doi: 10.1002/pro.5189.
6
Neuroepigenetic Editing.神经表观遗传学编辑。
Methods Mol Biol. 2024;2842:129-152. doi: 10.1007/978-1-0716-4051-7_6.
7
Systems for Targeted Silencing of Gene Expression and Their Application in Plants and Animals.靶向基因表达沉默系统及其在动植物中的应用。
Int J Mol Sci. 2024 May 11;25(10):5231. doi: 10.3390/ijms25105231.
8
Identification of stress-induced epigenetic methylation onto dopamine D2 gene and neurological and behavioral consequences.应激诱导的多巴胺D2基因表观遗传甲基化的鉴定及其神经学和行为学后果。
Gene Protein Dis. 2024 Mar 29;3(1). doi: 10.36922/gpd.1966.
9
Designer TALEs enable discovery of cell death-inducer genes.设计型 TALEs 可用于发现细胞凋亡诱导基因。
Plant Physiol. 2024 Jul 31;195(4):2985-2996. doi: 10.1093/plphys/kiae230.
10
Epigenetic control of multiple genes with a lentiviral vector encoding transcriptional repressors fused to compact zinc finger arrays.利用编码与紧密锌指阵列融合的转录抑制因子的慢病毒载体对多个基因进行表观遗传控制。
Mol Ther Methods Clin Dev. 2024 Apr 24;32(2):101255. doi: 10.1016/j.omtm.2024.101255. eCollection 2024 Jun 13.
转录激活因子样效应物工具盒用于基因组工程。
Nat Protoc. 2012 Jan 5;7(1):171-92. doi: 10.1038/nprot.2011.431.
4
Targeted transcriptional repression using a chimeric TALE-SRDX repressor protein.靶向转录抑制使用嵌合 TALE-SRDX 抑制蛋白。
Plant Mol Biol. 2012 Feb;78(3):311-21. doi: 10.1007/s11103-011-9866-x. Epub 2011 Dec 14.
5
TAL effectors: customizable proteins for DNA targeting.TAL 效应因子:可定制的 DNA 靶向蛋白。
Science. 2011 Sep 30;333(6051):1843-6. doi: 10.1126/science.1204094.
6
Heritable gene targeting in zebrafish using customized TALENs.使用定制的转录激活样效应因子核酸酶(TALENs)在斑马鱼中进行可遗传的基因靶向。
Nat Biotechnol. 2011 Aug 5;29(8):699-700. doi: 10.1038/nbt.1939.
7
Transcriptional activators of human genes with programmable DNA-specificity.具有可编程 DNA 特异性的人类基因转录激活剂。
PLoS One. 2011;6(5):e19509. doi: 10.1371/journal.pone.0019509. Epub 2011 May 19.
8
Alchemical free energy methods for drug discovery: progress and challenges.用于药物发现的炼金术自由能方法:进展与挑战。
Curr Opin Struct Biol. 2011 Apr;21(2):150-60. doi: 10.1016/j.sbi.2011.01.011. Epub 2011 Feb 23.
9
De novo-engineered transcription activator-like effector (TALE) hybrid nuclease with novel DNA binding specificity creates double-strand breaks.从头设计的转录激活因子样效应物(TALE)杂合核酸酶具有新型 DNA 结合特异性,可产生双链断裂。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Feb 8;108(6):2623-8. doi: 10.1073/pnas.1019533108. Epub 2011 Jan 24.
10
Efficient construction of sequence-specific TAL effectors for modulating mammalian transcription.高效构建序列特异性 TAL 效应因子,用于调节哺乳动物转录。
Nat Biotechnol. 2011 Feb;29(2):149-53. doi: 10.1038/nbt.1775. Epub 2011 Jan 19.