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iBRAIN2:用于RNA干扰筛选的自动化分析与数据处理

iBRAIN2: automated analysis and data handling for RNAi screens.

作者信息

Rouilly Vincent, Pujadas Eva, Hullár Béla, Balázs Csaba, Kunszt Peter, Podvinec Michael

机构信息

University of Basel, Switzerland.

出版信息

Stud Health Technol Inform. 2012;175:205-13.

PMID:22942012
Abstract

We report on the implementation of a software suite dedicated to the management and analysis of large scale RNAi High Content Screening (HCS). We describe the requirements identified amongst our different users, the supported data flow, and the implemented software. Our system is already supporting productively three different laboratories operating in distinct IT infrastructures. The system was already used to analyze hundreds of RNAi HCS plates.

摘要

我们报告了一套专门用于大规模RNA干扰高内涵筛选(HCS)管理与分析的软件套件的实施情况。我们描述了在不同用户中确定的需求、支持的数据流以及所实施的软件。我们的系统已经在高效支持三个在不同IT基础设施中运作的不同实验室。该系统已被用于分析数百个RNA干扰高内涵筛选板。

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