• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

mRNA 的 2'-OH 对于其密码子在 40S 核糖体 P 位的结合至关重要,但对于在 mRNA 进入位点的结合则不重要。

2'-OH of mRNA are critical for the binding of its codons at the 40S ribosomal P site but not at the mRNA entry site.

机构信息

Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Novosibirsk 630090, Russia.

出版信息

FEBS Lett. 2012 Oct 19;586(20):3731-6. doi: 10.1016/j.febslet.2012.09.003. Epub 2012 Sep 13.

DOI:10.1016/j.febslet.2012.09.003
PMID:22982860
Abstract

The roles of 2'-OH groups in the binding of mRNA to human ribosomes were studied using site-directed cross-linking. We found that both mRNA and mDNA analogues bearing a cross-linker can modify ribosomal proteins (rps) S3e and S2e at the mRNA entry site independently on tRNA presence, but only mRNA analogues were capable of a tRNA(Phe)-dependent binding to human ribosomes and cross-linking to rpS26e in the mRNA binding centre. Thus, 2'-OH groups of mRNA are unimportant for binding at the entry site but they are crucial for codon-anticodon interactions at the P site, implying the existence of mRNA-ribosome contacts that do not occur in bacteria.

摘要

使用定点交联研究了 2'-OH 基团在 mRNA 与人核糖体结合中的作用。我们发现,带有交联剂的 mRNA 和 mDNA 类似物都可以在 tRNA 存在的情况下独立于 tRNA 存在而修饰 mRNA 进入位点处的核糖体蛋白 (rps) S3e 和 S2e,但只有 mRNA 类似物能够依赖于 tRNA(Phe)与人核糖体结合并交联到 mRNA 结合中心的 rpS26e。因此,mRNA 的 2'-OH 基团对于进入位点的结合不重要,但对于 P 位的密码子-反密码子相互作用至关重要,这意味着存在不发生在细菌中的 mRNA-核糖体接触。

相似文献

1
2'-OH of mRNA are critical for the binding of its codons at the 40S ribosomal P site but not at the mRNA entry site.mRNA 的 2'-OH 对于其密码子在 40S 核糖体 P 位的结合至关重要,但对于在 mRNA 进入位点的结合则不重要。
FEBS Lett. 2012 Oct 19;586(20):3731-6. doi: 10.1016/j.febslet.2012.09.003. Epub 2012 Sep 13.
2
Molecular contacts of ribose-phosphate backbone of mRNA with human ribosome.信使核糖核酸(mRNA)的核糖磷酸骨架与人核糖体的分子接触。
Biochim Biophys Acta. 2015 Aug;1849(8):930-9. doi: 10.1016/j.bbagrm.2015.06.001. Epub 2015 Jun 8.
3
[Positioning of mRNA 3' of the a site bound codon on the human 80S ribosome].[人80S核糖体上与A位点结合密码子3'端的mRNA定位]
Mol Biol (Mosk). 2005 Nov-Dec;39(6):999-1007.
4
A new model for the three-dimensional folding of Escherichia coli 16 S ribosomal RNA. III. The topography of the functional centre.大肠杆菌16S核糖体RNA三维折叠的新模型。III. 功能中心的拓扑结构。
J Mol Biol. 1997 Aug 29;271(4):566-87. doi: 10.1006/jmbi.1997.1212.
5
Analysis of the roles of tRNA structure, ribosomal protein L9, and the bacteriophage T4 gene 60 bypassing signals during ribosome slippage on mRNA.在核糖体在信使核糖核酸(mRNA)上发生滑动期间,对转运核糖核酸(tRNA)结构、核糖体蛋白L9以及噬菌体T4基因60的通读信号所起作用的分析。
J Mol Biol. 2001 Jun 22;309(5):1029-48. doi: 10.1006/jmbi.2001.4717.
6
[Part of the matrix on the 5' side from codon in the E-segment is close to protein S26 on the human 80S ribosome].[E段中密码子5'侧的部分矩阵靠近人类80S核糖体上的蛋白质S26]。
Mol Biol (Mosk). 2004 Nov-Dec;38(6):1033-40.
7
The first position of a codon placed in the A site of the human 80S ribosome contacts nucleotide C1696 of the 18S rRNA as well as proteins S2, S3, S3a, S30, and S15.置于人类80S核糖体A位点的密码子的第一个位置与18S rRNA的核苷酸C1696以及蛋白质S2、S3、S3a、S30和S15接触。
Biochemistry. 2005 Feb 15;44(6):2153-62. doi: 10.1021/bi0487802.
8
The human ribosome can interact with the abasic site in mRNA via a specific peptide of the uS3 protein located near the mRNA entry channel.核糖体可通过位于 mRNA 进入通道附近的 uS3 蛋白的特定肽与 mRNA 中的无碱基位点相互作用。
Biochimie. 2019 Mar;158:117-125. doi: 10.1016/j.biochi.2018.12.015. Epub 2018 Dec 27.
9
Rps3/uS3 promotes mRNA binding at the 40S ribosome entry channel and stabilizes preinitiation complexes at start codons.核糖体蛋白S3/uS3促进mRNA在40S核糖体进入通道处的结合,并稳定起始密码子处的起始前复合物。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Mar 14;114(11):E2126-E2135. doi: 10.1073/pnas.1620569114. Epub 2017 Feb 21.
10
Splitting of the posttermination ribosome into subunits by the concerted action of RRF and EF-G.通过核糖体释放因子(RRF)和延伸因子G(EF-G)的协同作用,使终止后的核糖体分裂成亚基。
Mol Cell. 2005 Jun 10;18(6):675-86. doi: 10.1016/j.molcel.2005.05.016.

引用本文的文献

1
Exploring the interactions of short RNAs with the human 40S ribosomal subunit near the mRNA entry site by EPR spectroscopy.通过电子顺磁共振波谱法研究短 RNA 与靠近 mRNA 入口位点的人 40S 核糖体亚基的相互作用。
Nucleic Acids Res. 2019 Dec 16;47(22):11850-11860. doi: 10.1093/nar/gkz1039.
2
Recognition but no repair of abasic site in single-stranded DNA by human ribosomal uS3 protein residing within intact 40S subunit.完整40S亚基中的人核糖体uS3蛋白对单链DNA中无碱基位点的识别但不修复
Nucleic Acids Res. 2017 Apr 20;45(7):3833-3843. doi: 10.1093/nar/gkx052.
3
Interaction of tRNA with eukaryotic ribosome.
转运RNA与真核生物核糖体的相互作用。
Int J Mol Sci. 2015 Mar 30;16(4):7173-94. doi: 10.3390/ijms16047173.