• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
Genome sequence of Afipia birgiae, a rare bacterium associated with Amoebae.阿菲波菌属基因组序列,一种与变形虫相关的罕见细菌。
J Bacteriol. 2012 Dec;194(24):7018. doi: 10.1128/JB.01918-12.
2
Description of Afipia birgiae sp. nov. and Afipia massiliensis sp. nov. and recognition of Afipia felis genospecies A.新物种比氏阿菲皮菌和马赛阿菲皮菌的描述以及阿菲皮菌属种阿菲皮猫的确认
Int J Syst Evol Microbiol. 2002 Sep;52(Pt 5):1773-1782. doi: 10.1099/00207713-52-5-1773.
3
Genome sequence of Reyranella massiliensis, a bacterium associated with amoebae.雷兰氏菌的基因组序列,一种与变形虫相关的细菌。
J Bacteriol. 2012 Oct;194(20):5698. doi: 10.1128/JB.01260-12.
4
Usefulness of rpoB gene sequencing for identification of Afipia and Bosea species, including a strategy for choosing discriminative partial sequences.rpoB基因测序在嗜阿菲菌属和博斯氏菌属物种鉴定中的应用,包括选择具有鉴别力的部分序列的策略。
Appl Environ Microbiol. 2003 Nov;69(11):6740-9. doi: 10.1128/AEM.69.11.6740-6749.2003.
5
Isolation and properties of methanesulfonate-degrading Afipia felis from Antarctica and comparison with other strains of A. felis.从南极洲分离出的降解甲磺酸盐的费氏阿菲波菌及其特性,与其他费氏阿菲波菌菌株的比较
Environ Microbiol. 2005 Jan;7(1):22-33. doi: 10.1111/j.1462-2920.2004.00661.x.
6
Genome sequence of Legionella tunisiensis strain LegM(T), a new Legionella species isolated from hypersaline lake water.突尼斯军团菌 LegM(T)株的基因组序列,一种从高盐湖水分离到的新的军团菌种。
J Bacteriol. 2012 Nov;194(21):5978. doi: 10.1128/JB.01456-12.
7
Legionella oakridgensis ATCC 33761 genome sequence and phenotypic characterization reveals its replication capacity in amoebae.嗜肺军团菌 oakridgensis ATCC 33761 基因组序列和表型特征表明其在变形虫中的复制能力。
Int J Med Microbiol. 2013 Dec;303(8):514-28. doi: 10.1016/j.ijmm.2013.07.003. Epub 2013 Jul 18.
8
Isolation and characterization of haloacetic acid-degrading Afipia spp. from drinking water.从饮用水中分离并鉴定可降解卤乙酸的阿菲皮亚菌属。
FEMS Microbiol Lett. 2009 Aug;297(2):203-8. doi: 10.1111/j.1574-6968.2009.01687.x.
9
Genome sequence of the protease-producing bacterium Rheinheimera nanhaiensis E407-8T, isolated from deep-sea sediment of the South China Sea.南海深海沉积物中分离到的产蛋白酶菌 Rheinheimera nanhaiensis E407-8T 的基因组序列。
J Bacteriol. 2012 Dec;194(24):7001-2. doi: 10.1128/JB.01922-12.
10
Isolation of novel Afipia septicemium and identification of previously unknown bacteria Bradyrhizobium sp. OHSU_III from blood of patients with poorly defined illnesses.从患有定义不明确疾病的患者血液中分离出新型阿菲波菌和以前未知的慢生根瘤菌属 OHSU_III 细菌。
PLoS One. 2013 Oct 14;8(10):e76142. doi: 10.1371/journal.pone.0076142. eCollection 2013.

引用本文的文献

1
Metagenomic analysis of heavy water-adapted bacterial communities.重水适应细菌群落的宏基因组分析。
Microb Genom. 2025 May;11(5). doi: 10.1099/mgen.0.001414.
2
Isolation of novel Afipia septicemium and identification of previously unknown bacteria Bradyrhizobium sp. OHSU_III from blood of patients with poorly defined illnesses.从患有定义不明确疾病的患者血液中分离出新型阿菲波菌和以前未知的慢生根瘤菌属 OHSU_III 细菌。
PLoS One. 2013 Oct 14;8(10):e76142. doi: 10.1371/journal.pone.0076142. eCollection 2013.

本文引用的文献

1
Toward almost closed genomes with GapFiller.使用 GapFiller 实现近乎闭合的基因组。
Genome Biol. 2012 Jun 25;13(6):R56. doi: 10.1186/gb-2012-13-6-r56.
2
The Pfam protein families database.Pfam 蛋白质家族数据库。
Nucleic Acids Res. 2012 Jan;40(Database issue):D290-301. doi: 10.1093/nar/gkr1065. Epub 2011 Nov 29.
3
Opera: reconstructing optimal genomic scaffolds with high-throughput paired-end sequences.Opera:利用高通量双末端序列重建最优基因组支架
J Comput Biol. 2011 Nov;18(11):1681-91. doi: 10.1089/cmb.2011.0170. Epub 2011 Sep 19.
4
Prodigal: prokaryotic gene recognition and translation initiation site identification.普罗迪格:原核基因识别和翻译起始位点鉴定。
BMC Bioinformatics. 2010 Mar 8;11:119. doi: 10.1186/1471-2105-11-119.
5
Amoebal pathogens as emerging causal agents of pneumonia.阿米巴病原体作为肺炎的新兴病因。
FEMS Microbiol Rev. 2010 May;34(3):260-80. doi: 10.1111/j.1574-6976.2009.00207.x. Epub 2009 Dec 17.
6
The RAST Server: rapid annotations using subsystems technology.RAST服务器:使用子系统技术进行快速注释。
BMC Genomics. 2008 Feb 8;9:75. doi: 10.1186/1471-2164-9-75.
7
New Afipia and Bosea strains isolated from various water sources by amoebal co-culture.通过变形虫共培养从各种水源中分离出的新阿菲皮亚菌和博斯氏菌菌株。
Syst Appl Microbiol. 2007 Nov;30(7):572-9. doi: 10.1016/j.syapm.2007.06.004. Epub 2007 Aug 16.
8
RNAmmer: consistent and rapid annotation of ribosomal RNA genes.RNAmmer:核糖体RNA基因的一致性快速注释
Nucleic Acids Res. 2007;35(9):3100-8. doi: 10.1093/nar/gkm160. Epub 2007 Apr 22.
9
Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors.微制造高密度皮升反应器中的基因组测序
Nature. 2005 Sep 15;437(7057):376-80. doi: 10.1038/nature03959. Epub 2005 Jul 31.
10
ARAGORN, a program to detect tRNA genes and tmRNA genes in nucleotide sequences.ARAGORN,一个用于在核苷酸序列中检测tRNA基因和tmRNA基因的程序。
Nucleic Acids Res. 2004 Jan 2;32(1):11-6. doi: 10.1093/nar/gkh152. Print 2004.

阿菲波菌属基因组序列,一种与变形虫相关的罕见细菌。

Genome sequence of Afipia birgiae, a rare bacterium associated with Amoebae.

机构信息

Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, CNRS, UMR 6236 - IRD 198, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.

出版信息

J Bacteriol. 2012 Dec;194(24):7018. doi: 10.1128/JB.01918-12.

DOI:10.1128/JB.01918-12
PMID:23209256
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3510551/
Abstract

Afipia birgiae is an alphaproteobacterium from the family Bradyrhizobiaceae, growing in amoebae, and a potential human pathogen. We sequenced the genome of type strain 34632(T). It is composed of 5,325,467 bp and contains 5,160 protein-coding genes and 53 RNA genes, including 3 rRNA genes.

摘要

阿菲波利亚伯克氏菌是土壤杆菌科的一种α变形菌,生长在变形虫体内,可能是人类病原体。我们对模式菌株 34632(T)进行了基因组测序。它由 5,325,467 bp 组成,包含 5,160 个蛋白编码基因和 53 个 RNA 基因,包括 3 个 rRNA 基因。